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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
24/06/2019 |
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Data da última atualização: |
24/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. |
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Afiliação: |
UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES. |
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Título: |
Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019. |
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DOI: |
10.17660/ActaHortic.2019.1239.22 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease. |
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Palavras-Chave: |
Abacaxi. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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773 $tActa Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
19/01/2017 |
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Data da última atualização: |
19/01/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Publicação em Anais de Congresso |
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Autoria: |
FISCHER, L. de R.; KUHLCAMP, K. T.; ZUCOLOTO, M.; BARRO, F. L. de S.; ZANUNCIO, C. S. D.; MOREIRA, S. O. |
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Afiliação: |
Larissa de Ramos Fischer, UFES; Karin Tesch Kuhlcamp, Incaper; Moises Zucoloto, UFES; Fabiola Lacerda de Souza Barros, Incaper; Cristina Simão Delesposte Zanuncio, Incaper; Sarah Ola Moreira, Incaper. |
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Título: |
Análise multivariada da divergência genética da cultivar do mamoeiro Rubi Incaper 511. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 19.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS GRADUAÇÃO, 15.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTIFÍCA JÚNIOR, 9.; ENCONTRO NACIONAL DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 5., 2015, São José dos Campos. Ciência, luz e tecnologia. São José dos Campos: UNIVAP, 2015. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O uso da análise multivariada na determinação da divergência genética tem sido vantajosa para identificar fontes de variabilidade, avaliar a importância dos caracteres para a divergência e identificar as combinações genéticas mais promissoras. Portanto, o objetivo deste trabalho foi utilizar tais técnicas para avaliar a divergência genética para caracteres de frutos, sementes e tolerância a doenças dentro da cultivar Rubi Incaper 511. Foram avaliados 13 caracteres em 150 indivíduos da ?Rubi Incaper 511? em condições de campo. Foi calculada a dissimilaridade genética pela Distância Euclidiana Média e o agrupamento dos indivíduos pelos métodos da Ligação Média Entre Grupo (UPGMA) e Tocher. Foi estimado o coeficiente de correlação cofenético e a importância relativa dos caracteres pelo método do Singh. No dendrograma formado pelo método UPGMA verificou-se a formação de cinco grupos, e pelo método de Tocher formou-se nove grupos. O coeficiente de correlação cofenético foi de 0,7537**. Os caracteres que mais contribuíram para a dissimilaridade genética foram largura da cavidade ovariana do fruto e a altura de inserção do primeiro fruto. Há diversidade genética disponível, o que permite identificar genitores para a realização de cruzamentos na 'Rubi Incaper 511'. |
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Palavras-Chave: |
Carica papaya; Importância de caracteres; Rubi Incaper 511; Técnicas de agrupamento; Variabilidade genética. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
http://biblioteca.incaper.es.gov.br/digital/bitstream/item/2637/1/BRT-analisemultivariadadadivergenciageneticadacultivardemamoeirorubiincaper-ola.pdf
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Marc: |
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245 $aAnálise multivariada da divergência genética da cultivar do mamoeiro Rubi Incaper 511.$h[electronic resource]
260 $aIn: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 19.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS GRADUAÇÃO, 15.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTIFÍCA JÚNIOR, 9.; ENCONTRO NACIONAL DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 5., 2015, São José dos Campos. Ciência, luz e tecnologia. São José dos Campos: UNIVAP$c2015
520 $aO uso da análise multivariada na determinação da divergência genética tem sido vantajosa para identificar fontes de variabilidade, avaliar a importância dos caracteres para a divergência e identificar as combinações genéticas mais promissoras. Portanto, o objetivo deste trabalho foi utilizar tais técnicas para avaliar a divergência genética para caracteres de frutos, sementes e tolerância a doenças dentro da cultivar Rubi Incaper 511. Foram avaliados 13 caracteres em 150 indivíduos da ?Rubi Incaper 511? em condições de campo. Foi calculada a dissimilaridade genética pela Distância Euclidiana Média e o agrupamento dos indivíduos pelos métodos da Ligação Média Entre Grupo (UPGMA) e Tocher. Foi estimado o coeficiente de correlação cofenético e a importância relativa dos caracteres pelo método do Singh. No dendrograma formado pelo método UPGMA verificou-se a formação de cinco grupos, e pelo método de Tocher formou-se nove grupos. O coeficiente de correlação cofenético foi de 0,7537**. Os caracteres que mais contribuíram para a dissimilaridade genética foram largura da cavidade ovariana do fruto e a altura de inserção do primeiro fruto. Há diversidade genética disponível, o que permite identificar genitores para a realização de cruzamentos na 'Rubi Incaper 511'.
653 $aCarica papaya
653 $aImportância de caracteres
653 $aRubi Incaper 511
653 $aTécnicas de agrupamento
653 $aVariabilidade genética
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700 1 $aZUCOLOTO, M.
700 1 $aBARRO, F. L. de S.
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700 1 $aMOREIRA, S. O.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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