Data/hora: 11/06/2024 20:51:55

Biblioteca(s): | Biblioteca Rui Tendinha.
Data corrente: | 26/12/2023
Data da última atualização: | 28/12/2023
Autoria: | ZAIDAN, I. R.; FERREIRA, A.; NOIA, L. R.; SANTOS, J. G.; ARRUDA, V. C. de; COUTO, D. P. do; BRAZ, R. A.; PARTELLI, F. L.; AZEVEDO, C. F.; FERREIRA, M. F. da S.; SENRA, J. F. de B.
Afiliação: | Iasmine Ramos Zaidan; AdÃƒÂ©sio Ferreira; Luina Ribeiro Noia; JÃƒÂ´natas Gomes Santos; Valderson Cabral de Arruda; Diego Pereira do Couto; Ramon Azevedo Braz; FÃƒÂ¡bio Luiz Partelli; Camila Ferreira Azevedo; Marcia Flores da Silva Ferreira; JoÃƒÂ£o Felipe de Brites Senra, Incaper.
Título: | Diversity and structure of Coffea canephora from old seminal crops in EspÃƒÂ­rito Santo, Brazil : genetic resources for coffee breeding.
Complemento do título: | Diversidade e estrutura de Coffea canephora de culturas seminais antigas no EspÃƒÂ­rito Santo, Brasil: recursos genÃƒÂ©ticos para o melhoramento do cafÃƒÂ©.
Ano de publicação: | 2023
Fonte/Imprenta: | Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 19, 2023.
Idioma: | Inglês

Conteúdo:

The Coffea canephora germplasm, found in old seed crops in southern EspÃƒÂ­rito Santo, Brazil, represents a valuable genetic resource for coffee breeding programs. However, the renewal of these crops by clonal cultivars can narrow down the genetic base. Thus, this study aims to characterize the genetic diversity and population structure of 280 C. canephora genotypes from selected matrices in old (15?46-year-old) seed crops from southern EspÃƒÂ­rito Santo using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. Out of the 9491 SNPs retrieved from the Diversity Array Technology? sequencing, 2542 high-quality SNPs were used for diversity and population STRUCTURE analyses, which detected two genetic pools. Cluster analysis revealed six clusters, some of which showed a high frequency of expected heterozygotes (HE), an indicative of the genetic diversity (GD) within this population. Clusters 4, 5, and 6, especially, harbor an abundance of heterozygous loci. High FST values were detected between clusters 4 and 2 (0.60), 2 and 5 (0.60), and 4 and 3 (0.50) and between the two genetic pools (0.59). This population?s higher GD indices demonstrate that the old seed crops from southern EspÃƒÂ­rito Santo constitute a noticeably rich germplasm bank. This valuable source must be maintained and conserved to ensure coffee crop sustainability since it can broaden the genetic base once reduced by the replacement of crops with clonal cultivars.

O germoplasma de Coffea canephora , encontrado em culturas de sementes antigas no sul do EspÃƒÂ­rito Santo, Brasil, representa um valioso recurso genÃƒÂ©tico para programas de melhoramento de cafÃƒÂ©. Contudo, a renovaÃƒÂ§ÃƒÂ£o destas culturas por cultivares clonais pode estreitar a base genÃƒÂ©tica. Assim, este estudo tem como objetivo caracterizar a diversidade genÃƒÂ©tica e a estrutura populacional de 280 genÃƒÂ³tipos de C. canephora provenientes de matrizes selecionadas em culturas de sementes antigas (15 a 46 anos) do sul do EspÃƒÂ­rito Santo, utilizando marcadores de Polimorfismo de NucleotÃƒÂ­deo ÃƒÅ¡nico (SNP). Dos 9.491 SNPs recuperados do sequenciamento Diversity Array Technology?, 2.542 SNPs de alta qualidade foram usados ??para anÃƒÂ¡lises de diversidade e ESTRUTURA populacional, que detectaram dois pools genÃƒÂ©ticos. A anÃƒÂ¡lise de cluster revelou seis clusters, alguns dos quais apresentaram alta frequÃƒÂªncia de heterozigotos esperados (HE), um indicativo da diversidade genÃƒÂ©tica (GD) nesta populaÃƒÂ§ÃƒÂ£o. Os clusters 4, 5 e 6, especialmente, abrigam uma abundÃƒÂ¢ncia de loci heterozigotos . Valores elevados de F ST foram detectados entre os clusters 4 e 2 (0,60), 2 e 5 (0,60) e 4 e 3 (0,50) e entre os dois pools genÃƒÂ©ticos (0,59). Os maiores ÃƒÂ­ndices de GD desta populaÃƒÂ§ÃƒÂ£o demonstram que as antigas culturas de sementes do sul do EspÃƒÂ­rito Santo constituem um banco de germoplasma visivelmente rico. Essa valiosa fonte deve ser mantida e conservada para garantir a sustentabilidade da cultura cafeeira, pois pode ampliar a base genÃƒÂ©tica uma vez reduzida pela substituiÃƒÂ§ÃƒÂ£o de culturas por cultivares clonais.

Palavras-Chave: | Espírito Santo (Estado); Improvement.
Thesagro: | Clone; Coffea Canephora.
Thesaurus NAL: | Genetics.
Categoria do assunto: | --
Registro original: | Biblioteca Rui Tendinha (BRT)
Exemplares: | BRT - (25381-1) - UMT - AP - DD -  -  -  - DIS