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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
08/07/2025 |
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Data da última atualização: |
08/07/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROCHA, R. B.; SUELA, M. M.; COMÉRIO, M.; RIVA-SOUZA, E. M.; SENRA, J. F. de B.; FERRÃO, M. A. G.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; VERDIN FILHO, A. C.; VOLPI, P. S.; FERRAO, L. F. V. |
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Afiliação: |
Rodrigo Barros Rocha, Incaper; Matheus Massariol Suela, Universidade da Flórida; Marcone Comério, Incaper; Elaine Manelli Riva-Souza, Incaper; João Felipe de Brites Senra, Incaper; Maria Amélia Gava Ferrão, Incaper/Embrapa Café; Romário Gava Ferrão, Incaper; Aymbiré Francisco Almeida da Fonseca, Incaper/Embrapa Café; Abraão Carlos Verdin Filho, Incaper; Paulo Sérgio Volpi, Incaper; Luis Felipe V. Ferrão, University of Florida. |
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Título: |
Genomic-assisted selection to guide mate allocation and leverage hybrid vigor in Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2025 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 21, n. 20, 2025. |
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DOI: |
10.1007/s11295-025-01705-w |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Coffee is one of the most widely consumed beverages globally, and Coffea canephora has become increasingly relevant for breeding programs due to its resilience to heat and other stresses. This species includes two commercially cultivated botanical varieties, Conilon and Robusta, which exhibit complementary traits and represent a valuable genetic resource. The germplasm collection maintained at the Brazilian institutions serve as an important source of C. canephora genetic diversity. In this study, we genotyped 387 C. canephora genotypes using over 42,000 SNP markers and combined this molecular information with field data to support breeding strategies focused on mate allocation and hybrid development. Population structure analyses revealed three major genetic clusters, largely aligned with the Conilon and Robusta botanical varieties. Predicted outcomes of selected crosses revealed high levels of heterozygosity and allelic complementarity in the offspring. Genetic parameter estimates showed that non-additive effects accounted for more than 40% of the total variance in yield-related traits. By integrating genomic information, we reduced the number of hybridizations to be performed by 99,63%, prioritizing combinations with higher genetic complementarity and better field traits. These findings demonstrate the efficiency gains obtained through the integration of genomic data into traditional selection strategies, offering a targeted and promising path for developing climate-resilient C. canephora cultivars tailored to growers? and market demands. MenosCoffee is one of the most widely consumed beverages globally, and Coffea canephora has become increasingly relevant for breeding programs due to its resilience to heat and other stresses. This species includes two commercially cultivated botanical varieties, Conilon and Robusta, which exhibit complementary traits and represent a valuable genetic resource. The germplasm collection maintained at the Brazilian institutions serve as an important source of C. canephora genetic diversity. In this study, we genotyped 387 C. canephora genotypes using over 42,000 SNP markers and combined this molecular information with field data to support breeding strategies focused on mate allocation and hybrid development. Population structure analyses revealed three major genetic clusters, largely aligned with the Conilon and Robusta botanical varieties. Predicted outcomes of selected crosses revealed high levels of heterozygosity and allelic complementarity in the offspring. Genetic parameter estimates showed that non-additive effects accounted for more than 40% of the total variance in yield-related traits. By integrating genomic information, we reduced the number of hybridizations to be performed by 99,63%, prioritizing combinations with higher genetic complementarity and better field traits. These findings demonstrate the efficiency gains obtained through th... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Cafeicultura; Coffea Canephora. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://link.springer.com/article/10.1007/s11295-025-01705-w
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Marc: |
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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| Registros recuperados : 561 | |
| 1. |  | BERNADO, W. de P.; SANTOS, A. R.; RODRIGUES, W. P.; MIRANDA, R. M. dos S. N. de.; RUAS, K. F.; BARONI, D. F.; SILVA, B. V. da; SOUZA, G. A. R. de.; ABREU, D. P.de; BARCELLOS, L. C. de S.; BARCELOS, L. F. T.; KOPPE, T. A.; MACHADO FILHO, J. A.; BAITELLE, D. C.; VERDIN FILHO, A. C.; BRESSAN-SMITH, R.; RAMALHO, J. C.; CAMPOSTRINI, E. Efeitos da exclusão da radiação ultravioleta nos pigmentos foliares do cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 3. |  | FERRÃO, M. A. G.; RIVA-SOUZA, E. M.; AZEVEDO, C.; VOLPI, P. S.; VOLPI, P. S.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, R. G.; MONTAGNON, C.; FERRÃO, L. F. V. Robust and smart: Inference on phenotypic plasticity of Coffea canephora reveals adaptation to alternative environments. Crop Science, p. 1â??16, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 4. |  | ZAIDAN, I. R.; FERREIRA, A.; NOIA, L. R.; SANTOS, J. G.; ARRUDA, V. C. de; COUTO, D. P. do; BRAZ, R. A.; PARTELLI, F. L.; AZEVEDO, C. F.; FERREIRA, M. F. da S.; SENRA, J. F. de B. Diversity and structure of Coffea canephora from old seminal crops in EspÃÂrito Santo, Brazil : genetic resources for coffee breeding. Diversidade e estrutura de Coffea canephora de culturas seminais antigas no EspÃÂrito Santo, Brasil: recursos genéticos para o melhoramento do café. Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 19, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
|    |
| 5. |  | BENASSI, V. L. R. M.; BENASSI, A. C. Desenvolvimento da broca-do-café, Hypothenemus hampei (Ferrari, 1867) (Coleoptera : Scolytidae), com frutos de diferentes graus de umidade de Coffea arabica e Coffea canephora. I: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas, MG. Resumos expandidos... Brasília, DF : Embrapa Café; Minasplan, 2000. 2 v. P. 1204-1206.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 6. |  | ROCHA, R. B.; SUELA, M. M.; COMÉRIO, M.; RIVA-SOUZA, E. M.; SENRA, J. F. de B.; FERRÃO, M. A. G.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; VERDIN FILHO, A. C.; VOLPI, P. S.; FERRAO, L. F. V. Genomic-assisted selection to guide mate allocation and leverage hybrid vigor in Coffea canephora. Tree Genetics & Genomes, v. 21, n. 20, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 7. |  | BORGHI, E. J.; FORNACIERI, G.; VERDIN FILHO, A. C.; SCHULTAIS, R.; SANTOS, J. C. dos; SALLIN, V. P.; SOUZA, G. S. de.; JESUS FREITAS, S. de; VOLPI, P. S.; COMÉRIO, M.; POSSE, S. C. P.; VIEIRA, L. J. D.; ZANONI JUNIOR, G.; PEREIRA, M . dos S. Mortalidade de genótipos de Coffea canephora em condições de campo. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 8. |  | POSSE, S. C. P.; RODRIGUES, W. N.; COMÉRIO, M.; DOUSSEAU, S.; POSSE, R. P.; VERDIN FILHO, A. C.; SENRA, J. F. de B.; VOLPI, P. S.; MACHADO FILHO, J. A. The intensity of the drying process influencing the germinative potential of seeds of Coffea canephora harvested from genotypes of early maturation. Pensar Acadêmico, Manhuaçu, v.20, n.1, p. 1-15, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 9. |  | LOPES JUNIOR, H.; ROCHA, R. B.; SILVA, A. N. R.; MORAES, A. de O.; ALVES, E. A.; ESPINDULA, M. C.; TEIXEIRA, A. L. Fruit and bean traits of the Coffea canephora genotypes most grown in western Amazon. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 59, p. 1-8, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 10. |  | FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, M. A. G.; DE MUNER, L. H. (Ed.). Conilon coffee. 3rd edition updated and expanded Vitória, ES : Incaper, 2019. 973p. 252.717.528 bytes. ePUB il. color
System required: Adobe Digital Editions
Acess mode: Wold Wide Web Tradução de: Marcelle Gualda Pasolini.
Esta publicação foi concebida em formato ePUB. Para sua leitura recomendamos o uso do aplicativo Adobe Digital Editions.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 11. |  | BRAGANÇA, S. M.; COSTA, A. N. da.; LANI, J. A. Absorção de nutrientes pelo cafeeiro Conilon (Coffea canephora Pierre ex Froenher) aos 3,6 anos de idade : macronutrientes. I: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas, MG. Resumos expandidos... Brasília, DF : Embrapa Café; Minasplan, 2000. 2 v. p. 1350-1352.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 12. |  | MARRACCINI, P.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H. J. O.; ELBELT, S.; VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; SILVA, V. A.; DaMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; LEROY, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. Journal of Experimental Botany, Oxford v. 63, n. 11, p. 4191-4212, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 13. |  | MORI, A. L. B.; GARCIA, A. de O.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, R. G.; BENASSI, M. de T. Sensory profile of conilon coffee brews from the state of Espírito Santo, Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 53, n. 9, p. 1061-1069, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 14. |  | MACHADO FILHO, J. A.; COSTA, P. R.; ARANTES, L. de O.; RODRIGUES, W. P.; CRASQUE, J.; DOUSSEAU, S. Yield and beverage quality of thirty-one Coffea canephora clones shaded by Hevea brasiliensis. Coffee Science, Lavras, v. 19, p. e192259, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 15. |  | GOMES, W. dos S.; PARTELLI, F. L.; OLIVEIRA, E. C. da S.; GUIMARAES, C. V.; SIMMER, M. M. B.; FILETE, C. A.; GUARÇONI, R. G.; LUZ, J. M. R. da; MORELI, A. P.; PEREIRA, L. L. Fermentation time and temperature induce changes in the volatile and sensory profile of Coffea canephora var. Conilon subjected to carbonic maceration. Journal of Food Composition and Analysis, v. 143, jul. 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 16. |  | SANTOS, L. F. L. dos; CRASQUE, J.; CERRI NETO, B.; ARANTES, L. de O.; DOUSSEAU, S. Qualidade fisiológica de sementes de Coffea Canephora em clones de maturação precoce e tardia. In: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 3. , Vitória, ES. Qualidade fisiológica de sementes de Coffea Canephora em clones de maturação precoce e tardia. Editores, Andréa Ferreira da Costa, Marlon Dutra Degli Esposti e Renato Corrêa Taques. Vitória, ES : Incaper, p. 78, 2024. p. 78| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 18. |  | FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; PACOVA, B. E. V. Melhoramento genético de Coffea canephora. In: FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; BRAGANÇA, S. M.; FERRÃO, M. A. G.; DE MUNER, L. H. (Ed.). Café Conilon. Vitória: Incaper, 2007. 120-173 p.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 19. |  | SENRA, J. F. de B.; SILVA, J. A. da; FERREIRA, A.; ESPOSTI, M. D.; SILVA, U. R.; MILHEIROS, I. S.; ZACARIAS, A. J. Seleção de modelos não lineares e o estudo do crescimento dos frutos de café conilon. Research, Society and Development, v. 11, n. 4, e21511427093, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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