|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
Data corrente: |
05/02/2016 |
Data da última atualização: |
02/07/2017 |
Tipo da produção científica: |
Publicação em Anais de Congresso |
Autoria: |
FERRÃO, L. F. V.; FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; GARCIA, A. F. |
Afiliação: |
Luis Felipe V. Ferrão, ESALQ/USP; Romário Gava Ferrão, Incaper; Maria Amélia Gava Ferrão, Incaper/Embrapa Café; Aymbiré Francisco Almeida da Fonseca, Incaper/Embrapa Café; Antônio Augusto Franco Garcia, ESALQ/USP. |
Título: |
Mixed model to multiple Harvest-Location trial applied to genomic prediction in Coffea canephora. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. não paginado. P1168. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Genomic Selection (GS) has been studied in several crops with potential to increase the rates of genetic gain and reduce the length of breeding cycle. Despite the relevance, there is a modest number of reports applied to the genus Coffea. Nevertheless, the effective implementation depends on the ability to consider genomic models that represent with adequate reliability the breeding scenario in which the specie are inserted. Coffee experimentation, in general, is represented for evaluations in multiples sites and harvests (MET), in order to understand the interaction magnitude and predicting the performance of untested genotypes. Therefore, the main objective of this study was investigate GS models that accommodate MET modeling. A expansion of the traditional GBLUP was proposed in order to accommodate the interactions in the GS model. Different scenarios that mimic the coffee breeding and models commonly used in the analysis were compared. In terms of goodness of fit this approach showed the lowest AIC and BIC values and, consequently, the best goodness of fit. The predictive capacity was measured by cross-validation and, in contrast with the GBLUP, the incorporation of the MET modeling showed higher predictive accuracy (on average 10-17% higher) and lower prediction errors. All the genomic analysis were performed using the Genotyping-by-sequencing (GBS) approach, which showed a good potential to be used in coffee breeding programs. Thus, as conclusion, the results achieved may be used as basis for additional studies into the Genus Coffea and expanded for other perennial crops, that have a similar experimentation design. MenosGenomic Selection (GS) has been studied in several crops with potential to increase the rates of genetic gain and reduce the length of breeding cycle. Despite the relevance, there is a modest number of reports applied to the genus Coffea. Nevertheless, the effective implementation depends on the ability to consider genomic models that represent with adequate reliability the breeding scenario in which the specie are inserted. Coffee experimentation, in general, is represented for evaluations in multiples sites and harvests (MET), in order to understand the interaction magnitude and predicting the performance of untested genotypes. Therefore, the main objective of this study was investigate GS models that accommodate MET modeling. A expansion of the traditional GBLUP was proposed in order to accommodate the interactions in the GS model. Different scenarios that mimic the coffee breeding and models commonly used in the analysis were compared. In terms of goodness of fit this approach showed the lowest AIC and BIC values and, consequently, the best goodness of fit. The predictive capacity was measured by cross-validation and, in contrast with the GBLUP, the incorporation of the MET modeling showed higher predictive accuracy (on average 10-17% higher) and lower prediction errors. All the genomic analysis were performed using the Genotyping-by-sequencing (GBS) approach, which showed a good potential to be used in coffee breeding programs. Thus, as... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Café Conilon; Coffea canephora; Genomic Selection. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
http://biblioteca.incaper.es.gov.br/digital/bitstream/item/2728/1/Mixed-Model-to-Multiple-Harvest-Location1.pdf
|
Marc: |
LEADER 02473nam a2200193 a 4500 001 1009544 005 2017-07-02 008 2016 bl uuuu u01u1 u #d 100 1 $aFERRÃO, L. F. V. 245 $aMixed model to multiple Harvest-Location trial applied to genomic prediction in Coffea canephora.$h[electronic resource] 260 $aIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. não paginado. P1168.$c1168 520 $aGenomic Selection (GS) has been studied in several crops with potential to increase the rates of genetic gain and reduce the length of breeding cycle. Despite the relevance, there is a modest number of reports applied to the genus Coffea. Nevertheless, the effective implementation depends on the ability to consider genomic models that represent with adequate reliability the breeding scenario in which the specie are inserted. Coffee experimentation, in general, is represented for evaluations in multiples sites and harvests (MET), in order to understand the interaction magnitude and predicting the performance of untested genotypes. Therefore, the main objective of this study was investigate GS models that accommodate MET modeling. A expansion of the traditional GBLUP was proposed in order to accommodate the interactions in the GS model. Different scenarios that mimic the coffee breeding and models commonly used in the analysis were compared. In terms of goodness of fit this approach showed the lowest AIC and BIC values and, consequently, the best goodness of fit. The predictive capacity was measured by cross-validation and, in contrast with the GBLUP, the incorporation of the MET modeling showed higher predictive accuracy (on average 10-17% higher) and lower prediction errors. All the genomic analysis were performed using the Genotyping-by-sequencing (GBS) approach, which showed a good potential to be used in coffee breeding programs. Thus, as conclusion, the results achieved may be used as basis for additional studies into the Genus Coffea and expanded for other perennial crops, that have a similar experimentation design. 653 $aCafé Conilon 653 $aCoffea canephora 653 $aGenomic Selection 700 1 $aFERRÃO, R. G. 700 1 $aFERRÃO, M. A. G. 700 1 $aFONSECA, A. F. A. da. 700 1 $aGARCIA, A. F.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
|
Registros recuperados : 476 | |
141. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | SILVA, V. M. da.; TEIXEIRA, A. F. R.; MENDONÇA, E. de S. Macrofauna de insetos da interface solo/serapilheira de uma plantação de café conilon (Coffea canephora), no município de Linhares, Norte do Espírito Santo : dados iniciais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Ciência, tecnologia e inovação: anais. Viçosa: UFV, 2008.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
143. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | VERDIN FILHO, A. C.; MAURI, A. L.; VOLPI, P. S.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; RODRIGUES, W. N.; JÚNIOR, S. de A.; COLODETTI, T. V. Growth and Quality of Clonal Plantlets of Conilon Coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) Influenced by Types of Cuttings. American Journal of Plant Sciences, 2014, 5, 2148-2153.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
145. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | SILVA, J. A. da S.; SENRA, J. F. de B.; SILVA, F. G. da; MILHEIROS, I. S.; VEIGA, J. C. da S.; ESPOSTI, M. D. Desempenho inicial de genótipos de Café Conilon cultivados em condições contrastantes de altitude. In: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 1. , Vitória, ES. Desempenho inicial de genótipos de Café Conilon cultivados em condições contrastantes de altitude. Editores, Andre Guarçoni Martins ... [et al]., Vitória, ES : Incaper, 2022. Anais... Vitória, ES : Incaper, p. 26, 2022.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
148. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | OLIVEIRA, F. T.G .; PREZOTTI, L. C.; VITORIA, R. Z.; FELIX, E. R.; SANTOS, D. T.; MOREIRA, M. Crescimento das plantas de café conilon (coffea canephora) em função de diferentes dosagens de adubação potássica revestida de polímeros. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISAS CAFEEIRAS, 44., 2018, Franca, SP. Nosso café, melhorado desde o pé: anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2018.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
149. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, L. F. V.; PACOVA, B. E. V. Melhoramento genético de Coffea canephora. In: FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, M. A. G.; DE MUNER, L. H. (Ed.). Café Conilon. 2 ed. atual. ampli. Vitória, ES: Incaper, p. 131-175, 2017.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
150. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | FERRÃO, L. F. V.; FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; GARCIA, A. F. Mixed model to multiple Harvest-Location trial applied to genomic prediction in Coffea canephora. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. não paginado. P1168.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
151. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | CHRISTO, B. F.; RODRIGUES, W. N.; VERDIN FILHO, A. C.; COLODETTI, T. V.; OLIVAS, D. B. L.; MARTINS, L. D.; OLIVEIRA, F. L. de.; TOMAZ. M. A. Morpho-agronomic characterization of genotypes of Conilon coffee intercropped with dwarf coconut palms. Australian Journal of Crop Science, v. 12, n. 9, p. 1479-1485, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
153. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | NUNES, J. R.; ARAÚJO, E. L.; VALFRÉ, P. P.; SOUZA, J. P. M.; MIRANDA, K. S.; POSSE, S. C. P. Viabilidade de sementes de Coffea canephora, cultivar 'EMCAPER 8151' - ROBUSTA TROPICAL, armazenadas em diferentes umidades. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SEMENTES, 20., 2017, Foz do Iguaçu. Informativo Abrates, v. 27, n. 2, p. 430, 2017.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
154. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | COMÉRIO, M.; VERDIN FILHO, A. C.; SENRA, J. F. de B.; VOLPI, P. S.; ANDRADE, S. de.; FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; MENDONÇA, R. F. de.; TOMAZ, M. A.; COLODETTI, T. V.; RODRIGUES, W. N.; BORGHI, E. J. A.; FORNACIARI, G.; PEREIRA, M. dos S.; ZANONI, K. P.; ZANONI JUNIOR, G. Análise comparativa de cafés Conilon e Arábica em sistema agroflorestal e em monocultivo. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
155. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | FORNAZIER, M. J.; MARTINS, D. dos S.; DE MUNER, L. H.; ARLEU, R. J. A.; BENASSI, V. L. R. M.; PAGIO, V.; ALMEIDA, L. F. de. Danos da broca-de-café em café armazenado em nível de propriedade agrícola no Estado do Espírito Santo. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas, MG. Resumos expandidos... Brasília, DF : Embrapa Café; Minasplan, 2000. p. 1164-1166.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
156. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | VERDIN FILHO, A. C.; FONSECA, A. F. A. da.; VOLPI, P. S.; FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; COMÉRIO, M.; SENRA, J. F. de B.; LIMA, I. de M.; POSSE, S. C. P.; RODRIGUES, W. N.; COLODETTI, T. V. MANEJO DE PODAS PARA O CAFÉ CONILON: Técnicas de Formação e Condução de Lavouras. Vitória, ES: Incaper, 2021. 60p. ePUB.Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/web/img/print.png) |
Registros recuperados : 476 | |
|
Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|