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Biblioteca(s):  Biblioteca Rui Tendinha.
Data corrente:  08/08/2019
Data da última atualização:  08/08/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; CRUZ, C. D.; SOUZA, F. de F.; FERRÃO, M. A. G.; ZAMBOLIM, Z.; SAKIYAMA, N. S.
Afiliação:  Luís Felipe V. Ferrão, UFV; Eveline T. Caixeta, Embrapa Cafe; Cosme D. Cruz, UFV; Flávio F. de Souza, Embrapa Rondônia; Maria Amélia Gava Ferrão, Incaper/Embrapa Café; Laércio Zambolim, UFV; Ney S. Sakiyama, UFV.
Título:  The effects of encoding data in diversity studies and the applicability of the weighting index approach for data analysis from different molecular markers.
Ano de publicação:  2014
Fonte/Imprenta:  Plant Systematics and Evolution, New York v. 300, p.1649-1661, feb. 2014.
DOI:  10.1007/s00606-014-09903
Idioma:  Português
Conteúdo:  The use of molecular markers to study genetic diversity represents a breakthrough in this area, because of the increase in polymorphism levels and phenotypic neutrality. Codominant markers, such as microsatellites (SSR), are sensitive enough to distinguish the heterozygotes in genetic studies. Despite this advantage, there are some studies that ignore this feature and work with encoded data because of the simplicity of the evaluation, existence of polyploids and need for the combined analysis of different types of molecular markers. Thus, our study aims to investigate the consequences of these encodings on simulated and real data. In addition, we suggest an alternative analysis for genetic evaluations using different molecular markers. For the simulated data, we proposed the following two scenarios: the first uses SNP markers, and the second SSR markers. For real data, we used the SSR genotyping data from Coffea canephora accessions maintained in the Embrapa Germplasm Collection. The genetic diversity was studied using cluster analysis, the dissimilarity index, and the Bayesian approach implemented in the STRUCTURE software. For the simulated data, we observed a loss of genetic information to the encoded data in both scenarios. The same result was observed in the coffee studies. This loss of information was discussed in the context of a plantbreeding program, and the consequences were weighted to germplasm evaluations and the selection of parents for hybridization. In the st... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Café canéfora; Café conilon; Codominant markers; Coffee; Diversidade genética; Dominant markers Germplasm; Marcadores dominantes; SSR STRUCTURE.
Thesagro:  Café; Coffea Canephora; Marcador molecular.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://biblioteca.incaper.es.gov.br/digital/bitstream/123456789/3664/1/the-effects-enconding-ferrao.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Biblioteca Rui Tendinha (BRT)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
BRT - MI22701 - 1UMTAP - DD

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Registros recuperados : 5
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1.Imagem marcado/desmarcadoZAMBOLIM, L.; SOUZA NETO, P. N. de.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; SAKIYAMA, N. S.; FERRÃO, R. G. Components of resistance of conilon coffee that reduce the rate of leaf rust development. Australasian Plant Pathology, p. 1-12, june 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: - - -
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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2.Imagem marcado/desmarcadoFERREIRA, A. B.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; FRANCHINI, E. de A.; COSTA, H.; ZAMBOLIM, L. Diversidade genética por AFLP de Colletotrichum gloeosporioides e C. kahawae isolados de cafeeiros. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. 5p.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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3.Imagem marcado/desmarcadoFERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; CRUZ, C. D.; SOUZA, F. de F.; FERRÃO, M. A. G.; ZAMBOLIM, Z.; SAKIYAMA, N. S. The effects of encoding data in diversity studies and the applicability of the weighting index approach for data analysis from different molecular markers. Plant Systematics and Evolution, New York v. 300, p.1649-1661, feb. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCAPUCHO, A. S.; ZAMBOLIM, L.; ROSADO, A. W. C.; FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; MACIEL-ZAMBOLIM, E.; CAIXETA, E. T. Resistência de Conilon Vitória 8142 à raça I de Hemileia vastatrix. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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5.Imagem marcado/desmarcadoROSADO, A. W. C.; ZAMBOLIM, L.; CAPUCHO, A. S.; FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; MACIEL-ZAMBOLIM, E.; CAIXETA, E. T. Resistência de Conilon Vitória 8142 à raça II de Himeleia vastatrix. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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