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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
26/12/2023 |
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Data da última atualização: |
28/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ZAIDAN, I. R.; FERREIRA, A.; NOIA, L. R.; SANTOS, J. G.; ARRUDA, V. C. de; COUTO, D. P. do; BRAZ, R. A.; PARTELLI, F. L.; AZEVEDO, C. F.; FERREIRA, M. F. da S.; SENRA, J. F. de B. |
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Afiliação: |
Iasmine Ramos Zaidan; Adésio Ferreira; Luina Ribeiro Noia; Jônatas Gomes Santos; Valderson Cabral de Arruda; Diego Pereira do Couto; Ramon Azevedo Braz; Fábio Luiz Partelli; Camila Ferreira Azevedo; Marcia Flores da Silva Ferreira; João Felipe de Brites Senra, Incaper. |
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Título: |
Diversity and structure of Coffea canephora from old seminal crops in EspÃÂrito Santo, Brazil : genetic resources for coffee breeding. |
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Complemento do título: |
Diversidade e estrutura de Coffea canephora de culturas seminais antigas no EspÃÂrito Santo, Brasil: recursos genéticos para o melhoramento do café. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 19, 2023. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The Coffea canephora germplasm, found in old seed crops in southern EspÃÂrito Santo, Brazil, represents a valuable genetic resource for coffee breeding programs. However, the renewal of these crops by clonal cultivars can narrow down the genetic base. Thus, this study aims to characterize the genetic diversity and population structure of 280 C. canephora genotypes from selected matrices in old (15?46-year-old) seed crops from southern EspÃÂrito Santo using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. Out of the 9491 SNPs retrieved from the Diversity Array Technology? sequencing, 2542 high-quality SNPs were used for diversity and population STRUCTURE analyses, which detected two genetic pools. Cluster analysis revealed six clusters, some of which showed a high frequency of expected heterozygotes (HE), an indicative of the genetic diversity (GD) within this population. Clusters 4, 5, and 6, especially, harbor an abundance of heterozygous loci. High FST values were detected between clusters 4 and 2 (0.60), 2 and 5 (0.60), and 4 and 3 (0.50) and between the two genetic pools (0.59). This population?s higher GD indices demonstrate that the old seed crops from southern EspÃÂrito Santo constitute a noticeably rich germplasm bank. This valuable source must be maintained and conserved to ensure coffee crop sustainability since it can broaden the genetic base once reduced by the replacement of crops with clonal cultivars.
O germoplasma de Coffea canephora , encontrado em culturas de sementes antigas no sul do EspÃÂrito Santo, Brasil, representa um valioso recurso genético para programas de melhoramento de café. Contudo, a renovação destas culturas por cultivares clonais pode estreitar a base genética. Assim, este estudo tem como objetivo caracterizar a diversidade genética e a estrutura populacional de 280 genótipos de C. canephora provenientes de matrizes selecionadas em culturas de sementes antigas (15 a 46 anos) do sul do EspÃÂrito Santo, utilizando marcadores de Polimorfismo de NucleotÃÂdeo Único (SNP). Dos 9.491 SNPs recuperados do sequenciamento Diversity Array Technology?, 2.542 SNPs de alta qualidade foram usados ??para análises de diversidade e ESTRUTURA populacional, que detectaram dois pools genéticos. A análise de cluster revelou seis clusters, alguns dos quais apresentaram alta frequência de heterozigotos esperados (HE), um indicativo da diversidade genética (GD) nesta população. Os clusters 4, 5 e 6, especialmente, abrigam uma abundância de loci heterozigotos . Valores elevados de F ST foram detectados entre os clusters 4 e 2 (0,60), 2 e 5 (0,60) e 4 e 3 (0,50) e entre os dois pools genéticos (0,59). Os maiores ÃÂndices de GD desta população demonstram que as antigas culturas de sementes do sul do EspÃÂrito Santo constituem um banco de germoplasma visivelmente rico. Essa valiosa fonte deve ser mantida e conservada para garantir a sustentabilidade da cultura cafeeira, pois pode ampliar a base genética uma vez reduzida pela substituição de culturas por cultivares clonais. MenosThe Coffea canephora germplasm, found in old seed crops in southern EspÃÂrito Santo, Brazil, represents a valuable genetic resource for coffee breeding programs. However, the renewal of these crops by clonal cultivars can narrow down the genetic base. Thus, this study aims to characterize the genetic diversity and population structure of 280 C. canephora genotypes from selected matrices in old (15?46-year-old) seed crops from southern EspÃÂrito Santo using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. Out of the 9491 SNPs retrieved from the Diversity Array Technology? sequencing, 2542 high-quality SNPs were used for diversity and population STRUCTURE analyses, which detected two genetic pools. Cluster analysis revealed six clusters, some of which showed a high frequency of expected heterozygotes (HE), an indicative of the genetic diversity (GD) within this population. Clusters 4, 5, and 6, especially, harbor an abundance of heterozygous loci. High FST values were detected between clusters 4 and 2 (0.60), 2 and 5 (0.60), and 4 and 3 (0.50) and between the two genetic pools (0.59). This population?s higher GD indices demonstrate that the old seed crops from southern EspÃÂrito Santo constitute a noticeably rich germplasm bank. This valuable source must be maintained and conserved to ensure coffee crop sustainability since it can broaden the genetic base once reduced by th... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Espírito Santo (Estado); Improvement. |
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Thesagro: |
Clone; Coffea Canephora. |
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Thesaurus NAL: |
Genetics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
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Origem |
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Registro |
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| Registros recuperados : 592 | |
| 1. |  | BERNADO, W. de P.; SANTOS, A. R.; RODRIGUES, W. P.; MIRANDA, R. M. dos S. N. de.; RUAS, K. F.; BARONI, D. F.; SILVA, B. V. da; SOUZA, G. A. R. de.; ABREU, D. P.de; BARCELLOS, L. C. de S.; BARCELOS, L. F. T.; KOPPE, T. A.; MACHADO FILHO, J. A.; BAITELLE, D. C.; VERDIN FILHO, A. C.; BRESSAN-SMITH, R.; RAMALHO, J. C.; CAMPOSTRINI, E. Efeitos da exclusão da radiação ultravioleta nos pigmentos foliares do cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 3. | | FERRÃO, M. A. G.; RIVA-SOUZA, E. M.; AZEVEDO, C.; VOLPI, P. S.; VOLPI, P. S.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, R. G.; MONTAGNON, C.; FERRÃO, L. F. V. Robust and smart: Inference on phenotypic plasticity of Coffea canephora reveals adaptation to alternative environments. Crop Science, p. 1â??16, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
|  |
| 4. | | ZAIDAN, I. R.; FERREIRA, A.; NOIA, L. R.; SANTOS, J. G.; ARRUDA, V. C. de; COUTO, D. P. do; BRAZ, R. A.; PARTELLI, F. L.; AZEVEDO, C. F.; FERREIRA, M. F. da S.; SENRA, J. F. de B. Diversity and structure of Coffea canephora from old seminal crops in EspÃÂrito Santo, Brazil : genetic resources for coffee breeding. Diversidade e estrutura de Coffea canephora de culturas seminais antigas no EspÃÂrito Santo, Brasil: recursos genéticos para o melhoramento do café. Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 19, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 5. | | BENASSI, V. L. R. M.; BENASSI, A. C. Desenvolvimento da broca-do-café, Hypothenemus hampei (Ferrari, 1867) (Coleoptera : Scolytidae), com frutos de diferentes graus de umidade de Coffea arabica e Coffea canephora. I: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas, MG. Resumos expandidos... Brasília, DF : Embrapa Café; Minasplan, 2000. 2 v. P. 1204-1206.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 6. | | CRASQUE, J.; SILVA, F. B. C.; COMÉRIO, M.; VOLPI, P. S.; ARANTES, L. de O.; MACHADO FILHO, J. A.; SCHMILDT, E. R.; OLIVEIRA, V. de S.; DIAS, C. da S.; DOUSSEAU-ARANTES, S. Escala fenologica de Coffea canephora genotipos precoces 104 e A1, intermediarios P2 e tardios 143. In: PARTELLI, Fábio Luiz (ed.). Anais do 3º Simpósio de Pesquisas e Tecnologias em Coffea canephora: adaptação às mudanças climáticas: livro de resumos expandidos. São Mateus, ES, 145-146, nov. 2025. São Mateus: UFES, 2025| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 7. | | ROCHA, R. B.; SUELA, M. M.; COMÉRIO, M.; RIVA-SOUZA, E. M.; SENRA, J. F. de B.; FERRÃO, M. A. G.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; VERDIN FILHO, A. C.; VOLPI, P. S.; FERRAO, L. F. V. Genomic-assisted selection to guide mate allocation and leverage hybrid vigor in Coffea canephora. Tree Genetics & Genomes, v. 21, n. 20, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 8. | | BORGHI, E. J.; FORNACIERI, G.; VERDIN FILHO, A. C.; SCHULTAIS, R.; SANTOS, J. C. dos; SALLIN, V. P.; SOUZA, G. S. de.; JESUS FREITAS, S. de; VOLPI, P. S.; COMÉRIO, M.; POSSE, S. C. P.; VIEIRA, L. J. D.; ZANONI JUNIOR, G.; PEREIRA, M . dos S. Mortalidade de genótipos de Coffea canephora em condições de campo. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 9. | | POSSE, S. C. P.; RODRIGUES, W. N.; COMÉRIO, M.; DOUSSEAU, S.; POSSE, R. P.; VERDIN FILHO, A. C.; SENRA, J. F. de B.; VOLPI, P. S.; MACHADO FILHO, J. A. The intensity of the drying process influencing the germinative potential of seeds of Coffea canephora harvested from genotypes of early maturation. Pensar Acadêmico, Manhuaçu, v.20, n.1, p. 1-15, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 10. | | MARTINS, D. dos S.; MORALES-SILVA, T.; PEDRONI, L. S.; FORNAZIER, M. J.; ZANÚNCIO JUNIOR, J. S.; VENTURA, J. A. Diversidade e distribuicao geografica de moscas-das-frutas e seus parasitoides em cafe Coffea canephora no estado do Espirito Santo. In: PARTELLI, Fábio Luiz (ed.). Anais do 3º Simpósio de Pesquisas e Tecnologias em Coffea canephora: adaptação às mudanças climáticas: livro de resumos expandidos. São Mateus, ES, p. 75-76, nov. 2025. São Mateus: UFES, 2025.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 11. | | LOPES JUNIOR, H.; ROCHA, R. B.; SILVA, A. N. R.; MORAES, A. de O.; ALVES, E. A.; ESPINDULA, M. C.; TEIXEIRA, A. L. Fruit and bean traits of the Coffea canephora genotypes most grown in western Amazon. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 59, p. 1-8, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 13. | | FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, M. A. G.; DE MUNER, L. H. (Ed.). Conilon Coffee. 3 edition updated and expanded Vitória, ES : Incaper, 2019. 973p System required: Adobe Reader
Acesses Mode: https://bibliotecaruitendinha.incaper.es.gov.br/ Translated from: Café Conilon, 2017 - Incaper.
English translation Marcele Gualda Pasolini.
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| 14. | | BRAGANÇA, S. M.; COSTA, A. N. da.; LANI, J. A. Absorção de nutrientes pelo cafeeiro Conilon (Coffea canephora Pierre ex Froenher) aos 3,6 anos de idade : macronutrientes. I: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas, MG. Resumos expandidos... Brasília, DF : Embrapa Café; Minasplan, 2000. 2 v. p. 1350-1352.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 15. | | MARRACCINI, P.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H. J. O.; ELBELT, S.; VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; SILVA, V. A.; DaMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; LEROY, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. Journal of Experimental Botany, Oxford v. 63, n. 11, p. 4191-4212, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 17. | | MACHADO FILHO, J. A.; COSTA, P. R.; ARANTES, L. de O.; RODRIGUES, W. P.; CRASQUE, J.; DOUSSEAU, S. Yield and beverage quality of thirty-one Coffea canephora clones shaded by Hevea brasiliensis. Coffee Science, Lavras, v. 19, p. e192259, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 18. | | GOMES, W. dos S.; PARTELLI, F. L.; OLIVEIRA, E. C. da S.; GUIMARAES, C. V.; SIMMER, M. M. B.; FILETE, C. A.; GUARÇONI, R. G.; LUZ, J. M. R. da; MORELI, A. P.; PEREIRA, L. L. Fermentation time and temperature induce changes in the volatile and sensory profile of Coffea canephora var. Conilon subjected to carbonic maceration. Journal of Food Composition and Analysis, v. 143, jul. 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 19. | | SANTOS, L. F. L. dos; CRASQUE, J.; CERRI NETO, B.; ARANTES, L. de O.; DOUSSEAU, S. Qualidade fisiológica de sementes de Coffea Canephora em clones de maturação precoce e tardia. In: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 3. , Vitória, ES. Qualidade fisiológica de sementes de Coffea Canephora em clones de maturação precoce e tardia. Editores, Andréa Ferreira da Costa, Marlon Dutra Degli Esposti e Renato Corrêa Taques. Vitória, ES : Incaper, p. 78, 2024. p. 78| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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