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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
Data corrente: |
13/01/2015 |
Data da última atualização: |
13/01/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MARRACCINI, P.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H. J. O.; ELBELT, S.; VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; SILVA, V. A.; DaMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; LEROY, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. |
Afiliação: |
Maria Amélia Gava Ferrão, Incaper/Embrapa Café. |
Título: |
Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Experimental Botany, Oxford v. 63, n. 11, p. 4191-4212, 2012. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The aim of this study was to investigate the molecular mechanisms underlying drought acclimation in coffee plants by the identification of candidate genes (CGs) using different approaches. The first approach used the data generated during the Brazilian Coffee expressed sequence tag (EST) project to select 13 CGs by an in silico analysis (electronic northern). The second approach was based on screening macroarrays spotted with plasmid DNA (coffee ESTs) with separate hybridizations using leaf cDNA probes from drought-tolerant and susceptible clones of Coffea canephora var. Conilon, grown under different water regimes. This allowed the isolation of seven additional CGs. The third approach used two-dimensional gel electrophoresis to identify proteins displaying differential accumulation in leaves of drought-tolerant and susceptible clones of C. canephora. Six of them were characterized by MALDI-TOF-MS/MS (matrix-assisted laser desorption-time of flight-tandem mass spectrometry) and the corresponding proteins were identified. Finally, additional CGs were selected from the literature, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) was performed to analyse the expression of all identified CGs. Altogether, >40 genes presenting differential gene expression during drought acclimation were identified, some of them showing different expression profiles between drought-tolerant and susceptible clones. Based on the obtained results, it can be concluded that factors involved a complex network of responses probably involving the abscisic signalling pathway and nitric oxide are major molecular determinants that might explain the better efficiency in controlling stomata closure and transpiration displayed by drought-tolerant clones of C. canephora. MenosThe aim of this study was to investigate the molecular mechanisms underlying drought acclimation in coffee plants by the identification of candidate genes (CGs) using different approaches. The first approach used the data generated during the Brazilian Coffee expressed sequence tag (EST) project to select 13 CGs by an in silico analysis (electronic northern). The second approach was based on screening macroarrays spotted with plasmid DNA (coffee ESTs) with separate hybridizations using leaf cDNA probes from drought-tolerant and susceptible clones of Coffea canephora var. Conilon, grown under different water regimes. This allowed the isolation of seven additional CGs. The third approach used two-dimensional gel electrophoresis to identify proteins displaying differential accumulation in leaves of drought-tolerant and susceptible clones of C. canephora. Six of them were characterized by MALDI-TOF-MS/MS (matrix-assisted laser desorption-time of flight-tandem mass spectrometry) and the corresponding proteins were identified. Finally, additional CGs were selected from the literature, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) was performed to analyse the expression of all identified CGs. Altogether, >40 genes presenting differential gene expression during drought acclimation were identified, some of them showing different expression profiles between drought-toler... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Candidate gene; Coffea canephora; Differential expression; Drought acclimation; Genética; Proteomic; Proteômica; Real time PCR. |
Thesagro: |
Café; Coffea canephora; Genetics. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Registros recuperados : 495 | |
1. | | BERNADO, W. de P.; SANTOS, A. R.; RODRIGUES, W. P.; MIRANDA, R. M. dos S. N. de.; RUAS, K. F.; BARONI, D. F.; SILVA, B. V. da; SOUZA, G. A. R. de.; ABREU, D. P.de; BARCELLOS, L. C. de S.; BARCELOS, L. F. T.; KOPPE, T. A.; MACHADO FILHO, J. A.; BAITELLE, D. C.; VERDIN FILHO, A. C.; BRESSAN-SMITH, R.; RAMALHO, J. C.; CAMPOSTRINI, E. Efeitos da exclusão da radiação ultravioleta nos pigmentos foliares do cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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3. | | FERRÃO, M. A. G.; RIVA-SOUZA, E. M.; AZEVEDO, C.; VOLPI, P. S.; VOLPI, P. S.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, R. G.; MONTAGNON, C.; FERRÃO, L. F. V. Robust and smart: Inference on phenotypic plasticity of Coffea canephora reveals adaptation to alternative environments. Crop Science, p. 1â??16, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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4. | | ZAIDAN, I. R.; FERREIRA, A.; NOIA, L. R.; SANTOS, J. G.; ARRUDA, V. C. de; COUTO, D. P. do; BRAZ, R. A.; PARTELLI, F. L.; AZEVEDO, C. F.; FERREIRA, M. F. da S.; SENRA, J. F. de B. Diversity and structure of Coffea canephora from old seminal crops in EspÃÂrito Santo, Brazil : genetic resources for coffee breeding. Diversidade e estrutura de Coffea canephora de culturas seminais antigas no EspÃÂrito Santo, Brasil: recursos genéticos para o melhoramento do café. Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 19, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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5. | | BENASSI, V. L. R. M.; BENASSI, A. C. Desenvolvimento da broca-do-café, Hypothenemus hampei (Ferrari, 1867) (Coleoptera : Scolytidae), com frutos de diferentes graus de umidade de Coffea arabica e Coffea canephora. I: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas, MG. Resumos expandidos... Brasília, DF : Embrapa Café; Minasplan, 2000. 2 v. P. 1204-1206.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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6. | | BORGHI, E. J.; FORNACIERI, G.; VERDIN FILHO, A. C.; SCHULTAIS, R.; SANTOS, J. C. dos; SALLIN, V. P.; SOUZA, G. S. de.; JESUS FREITAS, S. de; VOLPI, P. S.; COMÉRIO, M.; POSSE, S. C. P.; VIEIRA, L. J. D.; ZANONI JUNIOR, G.; PEREIRA, M . dos S. Mortalidade de genótipos de Coffea canephora em condições de campo. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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7. | | POSSE, S. C. P.; RODRIGUES, W. N.; COMÉRIO, M.; DOUSSEAU, S.; POSSE, R. P.; VERDIN FILHO, A. C.; SENRA, J. F. de B.; VOLPI, P. S.; MACHADO FILHO, J. A. The intensity of the drying process influencing the germinative potential of seeds of Coffea canephora harvested from genotypes of early maturation. Pensar Acadêmico, Manhuaçu, v.20, n.1, p. 1-15, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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8. | | FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, M. A. G.; DE MUNER, L. H. (Ed.). Conilon coffee. 3rd edition updated and expanded Vitória, ES : Incaper, 2019. 973p. 252.717.528 bytes. ePUB il. color
System required: Adobe Digital Editions
Acess mode: Wold Wide Web Tradução de: Marcelle Gualda Pasolini.
Esta publicação foi concebida em formato ePUB. Para sua leitura recomendamos o uso do aplicativo Adobe Digital Editions.Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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9. | | BRAGANÇA, S. M.; COSTA, A. N. da.; LANI, J. A. Absorção de nutrientes pelo cafeeiro Conilon (Coffea canephora Pierre ex Froenher) aos 3,6 anos de idade : macronutrientes. I: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas, MG. Resumos expandidos... Brasília, DF : Embrapa Café; Minasplan, 2000. 2 v. p. 1350-1352.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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10. | | MARRACCINI, P.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H. J. O.; ELBELT, S.; VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; SILVA, V. A.; DaMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; LEROY, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. Journal of Experimental Botany, Oxford v. 63, n. 11, p. 4191-4212, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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11. | | MORI, A. L. B.; GARCIA, A. de O.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, R. G.; BENASSI, M. de T. Sensory profile of conilon coffee brews from the state of Espírito Santo, Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 53, n. 9, p. 1061-1069, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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12. | | SANTOS, L. F. L. dos; CRASQUE, J.; CERRI NETO, B.; ARANTES, L. de O.; DOUSSEAU, S. Qualidade fisiológica de sementes de Coffea Canephora em clones de maturação precoce e tardia. In: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 3. , Vitória, ES. Qualidade fisiológica de sementes de Coffea Canephora em clones de maturação precoce e tardia. Editores, Andréa Ferreira da Costa, Marlon Dutra Degli Esposti e Renato Corrêa Taques. Vitória, ES : Incaper, p. 78, 2024. p. 78Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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14. | | FERRÃO, R. G.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; PACOVA, B. E. V. Melhoramento genético de Coffea canephora. In: FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; BRAGANÇA, S. M.; FERRÃO, M. A. G.; DE MUNER, L. H. (Ed.). Café Conilon. Vitória: Incaper, 2007. 120-173 p.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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15. | | SENRA, J. F. de B.; SILVA, J. A. da; FERREIRA, A.; ESPOSTI, M. D.; SILVA, U. R.; MILHEIROS, I. S.; ZACARIAS, A. J. Seleção de modelos não lineares e o estudo do crescimento dos frutos de café conilon. Research, Society and Development, v. 11, n. 4, e21511427093, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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17. | | FILETE, C. A.; MOREIRA, T. R.; SANTOS, A. R. dos; GOMES, W. dos S.; GUARÇONI, R. G.; MORELI, A. P.; AUGUSTO, M. I.; ABREU, R. de O.; SIMMER, M. B.; CALIMAN, A. D. C.; GUIMARÃES, C. V.; BERELLI, S. da S.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; PARTELLI, F. L.; BERILLI, A. P. C. G.; OLIVEIRA, E. C. da S.; PEREIRA, L. L. The New Standpoints for the Terroir of Coffea canephora from Southwestern Brazil: Edaphic and Sensorial Perspective. Agronomy, v. 12, n. 8, p. 1-17, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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18. | | BENIÇÃ?, A. P.; COSTA, P. R.; DOUSSEAU, S.; ARANTES, L. de O.; MACHADO FILHO, J. A. Influência de genótipos clonais de Coffea Canephora e dos diferentes estádios maturação de seus frutos sobre o rendimento e a condutividade elétrica das sementes. In: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 3. , Vitória, ES. Influência de genótipos clonais de Coffea Canephora e dos diferentes estádios maturação de seus frutos sobre o rendimento e a condutividade elétrica das sementes. Editores, Andréa Ferreira da Costa, Marlon Dutra Degli Esposti e Renato Corrêa Taques. Vitória, ES : Incaper, p. 87, 2024. p. 87Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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19. | | MARTINS, D. dos S.; FORNAZIER, M. J.; VENTURA, J. A.; PIROVANI, V. D.; URAMOTO, K.; GUARÇONI, R. G.; CULIK, M. P.; FERREIRA, P. S. F.; ZANUNCIO, J. C. Coffea arabica and C. canephora as host plants for fruit flies (Tephritidae) and implications for commercial fruit crop pest management. Crop Protection, v. 156, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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20. | | PARTELLI, F. L.; MARRÉ, W. B.; FALQUETO, A. R.; VIEIRA, H. D.; CAVATTI, P. C. Seasonal vegetative growth in genotypes of coffea canephora, as related to climatic factors. Journal of Agricultural Science, [S.l.], v. 5, n. 8, p. p. 108-116, july 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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