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| Registros recuperados : 9 | |
| 1. |  | BOSISIO, F.; VALLE, J. de B.; RODRIGUES, C. J. S.; CATANE, F.; DALLAPICOLA, K. T. A aquicultura familiar comercial como promotora social da agricultura familiar do município de Anchieta, litoral Sul do Espírito Santo. In:CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA, ADMINISTRAÇÃO E SOCIOLOGIA RURAL, 50., 2012, Vitória. Agricultura e desenvolvimento rural com sustentabilidade: anais. Vitória: SOBER: UFES, 2012. SOBER 2012.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 2. | | AMÉRICO, M.; AOKI, P. C. M.; BOSISIO, F; AMORIM, B.; FONTES, L. A extensão rural na prática organizativa dos agricultores familiares da comunidade do Córrego do Mosquito, Jaguaré - ES. In: Cadernos de Agroecologia, v. 8, n. 2, nov. 2013. Edição dos Resumos do VIII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Porto Alegre, nov. 2013. 4 p.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 3. | | BOSISIO, F.; CRISTO, G.; FERNANDES FILHO, J. A.; SENA, S. L.; FONTES, L. A integração dos Programas de Aquisição de Alimentos - MDS e Mesa Brasil - SESC, como estratégia para a promoção da segurança alimentar e nutricional e da comercialização dos produtos da agricultura familiar. In: Cadernos de Agroecologia, v. 8, n. 2, nov. 2013. Edição dos Resumos do VIII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Porto Alegre, nov. 2013. 4 p.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 4. | | BOSISIO, F.; CRISTO, G.; AOKI, P. C. M.; SENA, S. L.; FONTES, L. A integração dos Programas de Aquisição de Alimentos - PAA e Banco de Alimentos Mesa Brasil - SESC, como estratégia para a promoção da segurança alimentar e nutricional e da comercialização dos produtos da agricultura familiar In: CONFASER, 12., Bento Gonçalves, RS, 2015. Anais...| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 5. | | CRISTO, G.; BOSISIO, F.; FERNANDES FILHO, J.; ASSIS, N. H.; MIRANDA, B. Criação de ferramentas e de metodologias para colaborar com a melhoria na apresentação de produtos de agroindústrias familiares. In: Cadernos de Agroecologia, v. 8, n. 2, nov. 2013. Edição dos Resumos do VIII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Porto Alegre, nov. 2013. Resumo.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 6. | | AOKI, P. C. M.; FONTES, L. L.; AMORIM, B. M.; BOSISIO, F.; FERNANDES FILHO, J. A. Estratégia interinstitucional implantada pelo projeto Tecsocial para que os agricultores familiares empoderados do Norte do Espírito Santo acessem o Programa de Aquisição de Alimentos - PAA In: Cadernos de Agroecologia, v. 8, n. 2, nov. 2013. Edição dos Resumos do VIII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Porto Alegre, nov. 2013. Resumo.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 7. | | CRISTO, G; BOSISIO, F.; FERNANDES FILHO, J. A.; ASSIS, N. H.; AMÉRICO, M. Experimentando a tecnologia : Favo com mel direto no vidro, no município de Águia Branca, ES. In: Cadernos de Agroecologia, v. 8, n. 2, nov. 2013. Edição dos Resumos do VIII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Porto Alegre, nov. 2013.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 8. | | CRISTO, G.; BOSISIO, F.; FERNANDES FILHO, J. A.; AMÉRICO, M.; ASSIS, N. H. O mapa das experiências da Associação Veneciana de Agroecologia de Nova Venécia - Universo Orgânico, ou o 'Caminho da Roça'. In: Cadernos de Agroecologia, v. 8, n. 2, nov. 2013. Edição dos Resumos do VIII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Porto Alegre, nov. 2013. Resumo.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 9. | | AOKI, P. C. M.; BOSISIO, F.; RODRIGUES, C. J. S.; DIAS, F. G.; KNACH, F. Projeto TECSOCIAL - tecnologias social em interface com a agregação de valor e a comercialização dos produtos da agricultura familiar e das comunidades tradicionais do Norte do Espírito Santo. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA, ADMINISTRAÇÃO E SOCIOLOGIA RURAL, 50., 2012, Vitória. Agricultura e desenvolvimento rural com sustentabilidade. Vitória: Sociedade Brasileira de Economia, Administração e Sociologia Rural, 2012. Resumo.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| Registros recuperados : 9 | |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
08/08/2019 |
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Data da última atualização: |
08/08/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; CRUZ, C. D.; SOUZA, F. de F.; FERRÃO, M. A. G.; ZAMBOLIM, Z.; SAKIYAMA, N. S. |
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Afiliação: |
Luís Felipe V. Ferrão, UFV; Eveline T. Caixeta, Embrapa Cafe; Cosme D. Cruz, UFV; Flávio F. de Souza, Embrapa Rondônia; Maria Amélia Gava Ferrão, Incaper/Embrapa Café; Laércio Zambolim, UFV; Ney S. Sakiyama, UFV. |
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Título: |
The effects of encoding data in diversity studies and the applicability of the weighting index approach for data analysis from different molecular markers. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Systematics and Evolution, New York v. 300, p.1649-1661, feb. 2014. |
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DOI: |
10.1007/s00606-014-09903 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
The use of molecular markers to study genetic diversity represents a breakthrough in this area, because of the increase in polymorphism levels and phenotypic neutrality. Codominant markers, such as microsatellites (SSR), are sensitive enough to distinguish the heterozygotes in genetic studies. Despite this advantage, there are some studies that ignore this feature and work with encoded data because of the simplicity of the evaluation, existence of polyploids and need for the combined analysis of different types of molecular markers. Thus, our study aims to investigate the consequences of these encodings on simulated and real data. In addition, we suggest an alternative analysis for genetic evaluations using different molecular markers. For the simulated data, we proposed the following two scenarios: the first uses SNP markers, and the second SSR markers. For real data, we used the SSR genotyping data from Coffea canephora accessions maintained in the Embrapa Germplasm Collection. The genetic diversity was studied using cluster analysis, the dissimilarity index, and the Bayesian approach implemented in the STRUCTURE software. For the simulated data, we observed a loss of genetic information to the encoded data in both scenarios. The same result was observed in the coffee studies. This loss of information was discussed in the context of a plantbreeding program, and the consequences were weighted to germplasm evaluations and the selection of parents for hybridization. In the studies that involved different types of markers, an alternative to the combined analysis is discussed, where the informativeness, coverage and quality of markers are weighted in the genetic diversity studies. MenosThe use of molecular markers to study genetic diversity represents a breakthrough in this area, because of the increase in polymorphism levels and phenotypic neutrality. Codominant markers, such as microsatellites (SSR), are sensitive enough to distinguish the heterozygotes in genetic studies. Despite this advantage, there are some studies that ignore this feature and work with encoded data because of the simplicity of the evaluation, existence of polyploids and need for the combined analysis of different types of molecular markers. Thus, our study aims to investigate the consequences of these encodings on simulated and real data. In addition, we suggest an alternative analysis for genetic evaluations using different molecular markers. For the simulated data, we proposed the following two scenarios: the first uses SNP markers, and the second SSR markers. For real data, we used the SSR genotyping data from Coffea canephora accessions maintained in the Embrapa Germplasm Collection. The genetic diversity was studied using cluster analysis, the dissimilarity index, and the Bayesian approach implemented in the STRUCTURE software. For the simulated data, we observed a loss of genetic information to the encoded data in both scenarios. The same result was observed in the coffee studies. This loss of information was discussed in the context of a plantbreeding program, and the consequences were weighted to germplasm evaluations and the selection of parents for hybridization. In the st... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Café canéfora; Café conilon; Codominant markers; Coffee; Diversidade genética; Dominant markers Germplasm; Marcadores dominantes; SSR STRUCTURE. |
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Thesagro: |
Café; Coffea Canephora; Marcador molecular. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://biblioteca.incaper.es.gov.br/digital/bitstream/123456789/3664/1/the-effects-enconding-ferrao.pdf
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Marc: |
LEADER 02777naa a2200337 a 4500
001 1021517
005 2019-08-08
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s00606-014-09903$2DOI
100 1 $aFERRÃO, L. F. V.
245 $aThe effects of encoding data in diversity studies and the applicability of the weighting index approach for data analysis from different molecular markers.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aThe use of molecular markers to study genetic diversity represents a breakthrough in this area, because of the increase in polymorphism levels and phenotypic neutrality. Codominant markers, such as microsatellites (SSR), are sensitive enough to distinguish the heterozygotes in genetic studies. Despite this advantage, there are some studies that ignore this feature and work with encoded data because of the simplicity of the evaluation, existence of polyploids and need for the combined analysis of different types of molecular markers. Thus, our study aims to investigate the consequences of these encodings on simulated and real data. In addition, we suggest an alternative analysis for genetic evaluations using different molecular markers. For the simulated data, we proposed the following two scenarios: the first uses SNP markers, and the second SSR markers. For real data, we used the SSR genotyping data from Coffea canephora accessions maintained in the Embrapa Germplasm Collection. The genetic diversity was studied using cluster analysis, the dissimilarity index, and the Bayesian approach implemented in the STRUCTURE software. For the simulated data, we observed a loss of genetic information to the encoded data in both scenarios. The same result was observed in the coffee studies. This loss of information was discussed in the context of a plantbreeding program, and the consequences were weighted to germplasm evaluations and the selection of parents for hybridization. In the studies that involved different types of markers, an alternative to the combined analysis is discussed, where the informativeness, coverage and quality of markers are weighted in the genetic diversity studies.
650 $aCafé
650 $aCoffea Canephora
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653 $aCafé canéfora
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653 $aCoffee
653 $aDiversidade genética
653 $aDominant markers Germplasm
653 $aMarcadores dominantes
653 $aSSR STRUCTURE
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700 1 $aCRUZ, C. D.
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700 1 $aFERRÃO, M. A. G.
700 1 $aZAMBOLIM, Z.
700 1 $aSAKIYAMA, N. S.
773 $tPlant Systematics and Evolution, New York$gv. 300, p.1649-1661, feb. 2014.
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