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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
Data corrente: |
26/12/2023 |
Data da última atualização: |
28/12/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
ZAIDAN, I. R.; FERREIRA, A.; NOIA, L. R.; SANTOS, J. G.; ARRUDA, V. C. de; COUTO, D. P. do; BRAZ, R. A.; PARTELLI, F. L.; AZEVEDO, C. F.; FERREIRA, M. F. da S.; SENRA, J. F. de B. |
Afiliação: |
Iasmine Ramos Zaidan; Adésio Ferreira; Luina Ribeiro Noia; Jônatas Gomes Santos; Valderson Cabral de Arruda; Diego Pereira do Couto; Ramon Azevedo Braz; Fábio Luiz Partelli; Camila Ferreira Azevedo; Marcia Flores da Silva Ferreira; João Felipe de Brites Senra, Incaper. |
Título: |
Diversity and structure of Coffea canephora from old seminal crops in EspÃÂrito Santo, Brazil : genetic resources for coffee breeding. |
Complemento do título: |
Diversidade e estrutura de Coffea canephora de culturas seminais antigas no EspÃÂrito Santo, Brasil: recursos genéticos para o melhoramento do café. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 19, 2023. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The Coffea canephora germplasm, found in old seed crops in southern EspÃÂrito Santo, Brazil, represents a valuable genetic resource for coffee breeding programs. However, the renewal of these crops by clonal cultivars can narrow down the genetic base. Thus, this study aims to characterize the genetic diversity and population structure of 280 C. canephora genotypes from selected matrices in old (15?46-year-old) seed crops from southern EspÃÂrito Santo using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. Out of the 9491 SNPs retrieved from the Diversity Array Technology? sequencing, 2542 high-quality SNPs were used for diversity and population STRUCTURE analyses, which detected two genetic pools. Cluster analysis revealed six clusters, some of which showed a high frequency of expected heterozygotes (HE), an indicative of the genetic diversity (GD) within this population. Clusters 4, 5, and 6, especially, harbor an abundance of heterozygous loci. High FST values were detected between clusters 4 and 2 (0.60), 2 and 5 (0.60), and 4 and 3 (0.50) and between the two genetic pools (0.59). This population?s higher GD indices demonstrate that the old seed crops from southern EspÃÂrito Santo constitute a noticeably rich germplasm bank. This valuable source must be maintained and conserved to ensure coffee crop sustainability since it can broaden the genetic base once reduced by the replacement of crops with clonal cultivars.
O germoplasma de Coffea canephora , encontrado em culturas de sementes antigas no sul do EspÃÂrito Santo, Brasil, representa um valioso recurso genético para programas de melhoramento de café. Contudo, a renovação destas culturas por cultivares clonais pode estreitar a base genética. Assim, este estudo tem como objetivo caracterizar a diversidade genética e a estrutura populacional de 280 genótipos de C. canephora provenientes de matrizes selecionadas em culturas de sementes antigas (15 a 46 anos) do sul do EspÃÂrito Santo, utilizando marcadores de Polimorfismo de NucleotÃÂdeo Único (SNP). Dos 9.491 SNPs recuperados do sequenciamento Diversity Array Technology?, 2.542 SNPs de alta qualidade foram usados ??para análises de diversidade e ESTRUTURA populacional, que detectaram dois pools genéticos. A análise de cluster revelou seis clusters, alguns dos quais apresentaram alta frequência de heterozigotos esperados (HE), um indicativo da diversidade genética (GD) nesta população. Os clusters 4, 5 e 6, especialmente, abrigam uma abundância de loci heterozigotos . Valores elevados de F ST foram detectados entre os clusters 4 e 2 (0,60), 2 e 5 (0,60) e 4 e 3 (0,50) e entre os dois pools genéticos (0,59). Os maiores ÃÂndices de GD desta população demonstram que as antigas culturas de sementes do sul do EspÃÂrito Santo constituem um banco de germoplasma visivelmente rico. Essa valiosa fonte deve ser mantida e conservada para garantir a sustentabilidade da cultura cafeeira, pois pode ampliar a base genética uma vez reduzida pela substituição de culturas por cultivares clonais. MenosThe Coffea canephora germplasm, found in old seed crops in southern EspÃÂrito Santo, Brazil, represents a valuable genetic resource for coffee breeding programs. However, the renewal of these crops by clonal cultivars can narrow down the genetic base. Thus, this study aims to characterize the genetic diversity and population structure of 280 C. canephora genotypes from selected matrices in old (15?46-year-old) seed crops from southern EspÃÂrito Santo using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. Out of the 9491 SNPs retrieved from the Diversity Array Technology? sequencing, 2542 high-quality SNPs were used for diversity and population STRUCTURE analyses, which detected two genetic pools. Cluster analysis revealed six clusters, some of which showed a high frequency of expected heterozygotes (HE), an indicative of the genetic diversity (GD) within this population. Clusters 4, 5, and 6, especially, harbor an abundance of heterozygous loci. High FST values were detected between clusters 4 and 2 (0.60), 2 and 5 (0.60), and 4 and 3 (0.50) and between the two genetic pools (0.59). This population?s higher GD indices demonstrate that the old seed crops from southern EspÃÂrito Santo constitute a noticeably rich germplasm bank. This valuable source must be maintained and conserved to ensure coffee crop sustainability since it can broaden the genetic base once reduced by the replacement of crops with clonal cultivars.
O germoplasma de Coffea canephora , encontrado em cultu... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Espírito Santo (Estado); Improvement. |
Thesagro: |
Clone; Coffea Canephora. |
Thesaurus NAL: |
Genetics. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 04127naa a2200301 a 4500 001 1025178 005 2023-12-28 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aZAIDAN, I. R. 245 $aDiversity and structure of Coffea canephora from old seminal crops in EspÃÂrito Santo, Brazil$bgenetic resources for coffee breeding.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aThe Coffea canephora germplasm, found in old seed crops in southern EspÃÂrito Santo, Brazil, represents a valuable genetic resource for coffee breeding programs. However, the renewal of these crops by clonal cultivars can narrow down the genetic base. Thus, this study aims to characterize the genetic diversity and population structure of 280 C. canephora genotypes from selected matrices in old (15?46-year-old) seed crops from southern EspÃÂrito Santo using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers. Out of the 9491 SNPs retrieved from the Diversity Array Technology? sequencing, 2542 high-quality SNPs were used for diversity and population STRUCTURE analyses, which detected two genetic pools. Cluster analysis revealed six clusters, some of which showed a high frequency of expected heterozygotes (HE), an indicative of the genetic diversity (GD) within this population. Clusters 4, 5, and 6, especially, harbor an abundance of heterozygous loci. High FST values were detected between clusters 4 and 2 (0.60), 2 and 5 (0.60), and 4 and 3 (0.50) and between the two genetic pools (0.59). This population?s higher GD indices demonstrate that the old seed crops from southern EspÃÂrito Santo constitute a noticeably rich germplasm bank. This valuable source must be maintained and conserved to ensure coffee crop sustainability since it can broaden the genetic base once reduced by the replacement of crops with clonal cultivars. O germoplasma de Coffea canephora , encontrado em culturas de sementes antigas no sul do EspÃÂrito Santo, Brasil, representa um valioso recurso genético para programas de melhoramento de café. Contudo, a renovação destas culturas por cultivares clonais pode estreitar a base genética. Assim, este estudo tem como objetivo caracterizar a diversidade genética e a estrutura populacional de 280 genótipos de C. canephora provenientes de matrizes selecionadas em culturas de sementes antigas (15 a 46 anos) do sul do EspÃÂrito Santo, utilizando marcadores de Polimorfismo de NucleotÃÂdeo Único (SNP). Dos 9.491 SNPs recuperados do sequenciamento Diversity Array Technology?, 2.542 SNPs de alta qualidade foram usados ??para análises de diversidade e ESTRUTURA populacional, que detectaram dois pools genéticos. A análise de cluster revelou seis clusters, alguns dos quais apresentaram alta frequência de heterozigotos esperados (HE), um indicativo da diversidade genética (GD) nesta população. Os clusters 4, 5 e 6, especialmente, abrigam uma abundância de loci heterozigotos . Valores elevados de F ST foram detectados entre os clusters 4 e 2 (0,60), 2 e 5 (0,60) e 4 e 3 (0,50) e entre os dois pools genéticos (0,59). Os maiores ÃÂndices de GD desta população demonstram que as antigas culturas de sementes do sul do EspÃÂrito Santo constituem um banco de germoplasma visivelmente rico. Essa valiosa fonte deve ser mantida e conservada para garantir a sustentabilidade da cultura cafeeira, pois pode ampliar a base genética uma vez reduzida pela substituição de culturas por cultivares clonais. 650 $aGenetics 650 $aClone 650 $aCoffea Canephora 653 $aEspírito Santo (Estado) 653 $aImprovement 700 1 $aFERREIRA, A. 700 1 $aNOIA, L. R. 700 1 $aSANTOS, J. G. 700 1 $aARRUDA, V. C. de 700 1 $aCOUTO, D. P. do 700 1 $aBRAZ, R. A. 700 1 $aPARTELLI, F. L. 700 1 $aAZEVEDO, C. F. 700 1 $aFERREIRA, M. F. da S. 700 1 $aSENRA, J. F. de B. 773 $tTree Genetics & Genomes$gv. 19, n. 19, 2023.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
Data corrente: |
15/01/2015 |
Data da última atualização: |
15/01/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
- - - |
Autoria: |
FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da.; SILVEIRA, J. S. M. da.; FERRÃO, M. A. G.; BRAGANÇA, S. M. |
Afiliação: |
Romário Gava Ferrão, Incaper; Aymbiré Francisco Almeida da Fonseca, Incaper/Embrapa Café; Maria Amélia Gava Ferrão, Incaper/Embrapa Café; Scheilla Marina Bragança, Incaper. |
Título: |
EMCAPA 8141 - ROBUSTÃO CAPIXABA : variedade clonal de café Conilon para a região da SUDENE no Estado do Espírito Santo. |
Ano de publicação: |
1999 |
Fonte/Imprenta: |
Revista das Faculdades de Linhares, n. 6, p. 77-82, out. 1999. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
No meio rural, a cafeicultura é a principal atividade econômica e social no Espírito Santo, sendo que, das 86 mil propriedades agrícolas, 56 mil cultivam o café. A atividade gera mais de 500 mil empregos, em uma área plantada de 526 mil hectares, em um parque de 950 milhões de covas, sendo 60% plantado com a variedade conilon. O estado é o segundo maior produtor de café do Brasil e o primeiro da variedade conilon. Mais de 80% dos plantios, são realizados por produtores de base familiar, que não têm condições de irrigar, por falta de recursos hídricos e/ou fatores econômicos, levando a uma redução média anual da produção de 40%, atingindo até 80% pelo problema da seca. Preocupada prioritariamente com esses produtores, a EMCAPA, hoje EMCAPER, após quatorze anos de pesquisa desenvolveu a EMCAPA 8141 - Robustão Capixaba: primeira variedade clonal de café conilon do Brasil tolerante à seca, prioritariamente para a região da SUDENE do Estado do Espírito Santo. O objetivo desse trabalho é mostrar os principais resultados das pesquisas bibliográfica, experimental e de laboratório executadas de 1985 a 1999 que levaram ao lançamento dessa cultivar. A EMCAPA 8141- Robustão Capixaba é uma cultivar que pode ser plantada em altitudes inferiores a 500 metros, por proporcionar aos produtores, principalmente aos não irrigantes, maior segurança, pela produtividade, qualidade de produção e características agronômicas e fisiológicas superiores, como: arquitetura adequada para poda e adensamento; maturação uniforme dos frutos; produtividade média em condições de estresses hídrico de 54,0 sacas beneficiadas/ha, podendo chegar até 112 sacas; alto vigor vegetativo, baixo desfolhamento, tolerância as principais doenças e tolerância à seca. MenosNo meio rural, a cafeicultura é a principal atividade econômica e social no Espírito Santo, sendo que, das 86 mil propriedades agrícolas, 56 mil cultivam o café. A atividade gera mais de 500 mil empregos, em uma área plantada de 526 mil hectares, em um parque de 950 milhões de covas, sendo 60% plantado com a variedade conilon. O estado é o segundo maior produtor de café do Brasil e o primeiro da variedade conilon. Mais de 80% dos plantios, são realizados por produtores de base familiar, que não têm condições de irrigar, por falta de recursos hídricos e/ou fatores econômicos, levando a uma redução média anual da produção de 40%, atingindo até 80% pelo problema da seca. Preocupada prioritariamente com esses produtores, a EMCAPA, hoje EMCAPER, após quatorze anos de pesquisa desenvolveu a EMCAPA 8141 - Robustão Capixaba: primeira variedade clonal de café conilon do Brasil tolerante à seca, prioritariamente para a região da SUDENE do Estado do Espírito Santo. O objetivo desse trabalho é mostrar os principais resultados das pesquisas bibliográfica, experimental e de laboratório executadas de 1985 a 1999 que levaram ao lançamento dessa cultivar. A EMCAPA 8141- Robustão Capixaba é uma cultivar que pode ser plantada em altitudes inferiores a 500 metros, por proporcionar aos produtores, principalmente aos não irrigantes, maior segurança, pela produtividade, qualidade de produção e características agronômicas e fisiológicas superiores, como: arquitetura adequada para poda e adensament... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Cafeicultura; Coffea canephora; Cultuvar; EMCAPA 8141; Espírito Santo (Estado); ROBUSTÃO CAPIXABA; SUDENE. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02587naa a2200253 a 4500 001 1004952 005 2015-01-15 008 1999 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aFERRÃO, R. G. 245 $aEMCAPA 8141 - ROBUSTÃO CAPIXABA$bvariedade clonal de café Conilon para a região da SUDENE no Estado do Espírito Santo.$h[electronic resource] 260 $c1999 520 $aNo meio rural, a cafeicultura é a principal atividade econômica e social no Espírito Santo, sendo que, das 86 mil propriedades agrícolas, 56 mil cultivam o café. A atividade gera mais de 500 mil empregos, em uma área plantada de 526 mil hectares, em um parque de 950 milhões de covas, sendo 60% plantado com a variedade conilon. O estado é o segundo maior produtor de café do Brasil e o primeiro da variedade conilon. Mais de 80% dos plantios, são realizados por produtores de base familiar, que não têm condições de irrigar, por falta de recursos hídricos e/ou fatores econômicos, levando a uma redução média anual da produção de 40%, atingindo até 80% pelo problema da seca. Preocupada prioritariamente com esses produtores, a EMCAPA, hoje EMCAPER, após quatorze anos de pesquisa desenvolveu a EMCAPA 8141 - Robustão Capixaba: primeira variedade clonal de café conilon do Brasil tolerante à seca, prioritariamente para a região da SUDENE do Estado do Espírito Santo. O objetivo desse trabalho é mostrar os principais resultados das pesquisas bibliográfica, experimental e de laboratório executadas de 1985 a 1999 que levaram ao lançamento dessa cultivar. A EMCAPA 8141- Robustão Capixaba é uma cultivar que pode ser plantada em altitudes inferiores a 500 metros, por proporcionar aos produtores, principalmente aos não irrigantes, maior segurança, pela produtividade, qualidade de produção e características agronômicas e fisiológicas superiores, como: arquitetura adequada para poda e adensamento; maturação uniforme dos frutos; produtividade média em condições de estresses hídrico de 54,0 sacas beneficiadas/ha, podendo chegar até 112 sacas; alto vigor vegetativo, baixo desfolhamento, tolerância as principais doenças e tolerância à seca. 653 $aCafeicultura 653 $aCoffea canephora 653 $aCultuvar 653 $aEMCAPA 8141 653 $aEspírito Santo (Estado) 653 $aROBUSTÃO CAPIXABA 653 $aSUDENE 700 1 $aFONSECA, A. F. A. da. 700 1 $aSILVEIRA, J. S. M. da. 700 1 $aFERRÃO, M. A. G. 700 1 $aBRAGANÇA, S. M. 773 $tRevista das Faculdades de Linhares$gn. 6, p. 77-82, out. 1999.
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