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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
Data corrente: |
24/06/2019 |
Data da última atualização: |
24/06/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. |
Afiliação: |
UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES. |
Título: |
Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019. |
DOI: |
10.17660/ActaHortic.2019.1239.22 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease. |
Palavras-Chave: |
Abacaxi. |
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 01796naa a2200265 a 4500 001 1021431 005 2019-06-24 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.17660/ActaHortic.2019.1239.22$2DOI 100 1 $aPERON, F. N. 245 $aBioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple.$h[electronic resource] 260 $c2019 520 $aMealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease. 650 $aBioinformatics 650 $aDESeq2 650 $aEdgeR 650 $aPineapple 650 $aPMWaV 650 $aSTAR 650 $aTranscriptomic 653 $aAbacaxi 700 1 $aCALLONI, R. 700 1 $aVENTURA, J. A. 700 1 $aFERNANDES, P. M. B. 773 $tActa Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
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Registros recuperados : 557 | |
210. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | MARTINS, D. dos S.; CULIK, M. P.; FORNAZIER, M. J.; VENTURA, J. A. Cochonilhas (Hemiptera: Coccoidea) como potenciais pragas do mamoeiro no Brasil. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 6., 2015, Vitória, ES. Tecnologia de produção e mercado para o mamão brasileiro : Anais... Vitória, ES : Incaper, 2015.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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212. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | TATAGIBA, J. S.; VENTURA, J. A.; COSTA, H.; FERRÃO, R. G.; MENDONÇA, L. F. Comportamento de clones de café conilon diante de doenças no Norte do Espírito Santo. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 2., 2001, Vitória, ES. Trabalhos apresentados... Brasília, DF : Embrapa Café, 2001. 5p.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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213. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | LIMA, I. de M.; FANTON, C. J.; GOMES, J. A.; VENTURA, J. A.; TARDIN, F. D. Comportamento de cultivares de bananeira (musa AAA e AAB) em três ciclos de produção em Linhares. In: SEMINÁRIO BRASILEIRO DE PRODUÇÃO INTEGRADA DE FRUTAS, 8., 2006, Vitória. Anais... Vitória: INCAPER, p. 147-148, 2006.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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216. | ![Imagem marcado/desmarcado](/web/img/desmarcado.png) | GALEANO, E. A. V.; VENTURA, J. A.; MARTINS, D. dos S. Avaliação do emprego na cadeia produtiva do mamão no Espírito Santo. In: SIMPÓSIO INCAPER PESQUISA, 1. , Vitória, ES. Avaliação do emprego na cadeia produtiva do mamão no Espírito Santo. Editores, Andre Guarçoni Martins... [et al]., Vitória, ES : Incaper, 2022. Anais... Vitória, ES : Incaper, p. 49, 2022.Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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