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Biblioteca(s):  Biblioteca Rui Tendinha.
Data corrente:  24/06/2019
Data da última atualização:  24/06/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B.
Afiliação:  UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES.
Título:  Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
DOI:  10.17660/ActaHortic.2019.1239.22
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease.
Palavras-Chave:  Abacaxi.
Thesaurus NAL:  Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Biblioteca Rui Tendinha (BRT)
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1.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, E. P.; FERREIRA, T. R.; AGUIAR, D. B.; ALVES, F. de L.; DOUSSEAU, S. Lithothamnion sp. as biostimulant in plant cultivation. Pesquisa Agropecuária Tropical, v. 23, p. 1-11, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCHEQUETTO, E.; KÜSTER, I. S.; RAMOS, E. P.; SOUZA, M. A. B. A agricultura familiar como um dos pilares do desenvolvimento sustentavel. In: SEMINÁRIOS DE SUSTENTABILIDADE DA PUC-CAMPINAS, 5.; WORKSHOP INTERNACIONAL DE PESQUISA EM INDICADORES DE SUSTENTABILIDADE E GESTÃO DE RECURSOS HÍDRICOS, 7., 2023. Sustentabilidade do futuro: livro de memórias do Sustentare & WIPIS. Campinas: Pontifícia Universidade Católica de Campinas, 2024. Sustentare & WIPIS 2023.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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3.Imagem marcado/desmarcadoKÜSTER, I. S.; OLIVEIRA, D. A. de; DOUSSEAU, S.; CHEQUETTO, E.; RAMOS, E. P.; SOUZA, M. A. B. Analise sensorial da aceitacao das cultivares de abacaxi Perola e Vitoria no mercado consumidor. INCAPER EM REVISTA, Vitoria, v. 25, p. 149?153, 2025. Relato.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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4.Imagem marcado/desmarcadoDOUSSEAU, S.; ARANTES, L. de O.; VENTURA, J. A.; MACHADO FILHO, J. A.; FERRARI, W. R.; RAMOS, E. P. Integracao pesquisa e ater no desenvolvimento de novas tecnologias para o cultivo da pimenteira-do-reino no Espirito Santo. In: SIMPOSIO INCAPER PESQUISA, 4., Seminário de Iniciação Científica do Incaper, 4., 2024, Vitoria. Desafios e potencialidades para a agropecuária, pesquisa e extensão na era da automação e inteligência artificial. Vitoria, ES : Incaper, 2025. p. 55. Editores: Andrea Ferreira da Costa, Jose Salazar Zanuncio Junior e Renato Correa Taques.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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5.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, L. B. da; RAMOS, E. P.; OLIVEIRA, J. B.-H.; ARANTES, L. de O.; DOUSSEAU, S. Uso de auxina na producao de mudas de pimenta-do-reino. In: SIMPOSIO INCAPER PESQUISA, 4., Seminário de Iniciação Científica do Incaper, 4., 2024, Vitoria. Desafios e potencialidades para a agropecuária, pesquisa e extensão na era da automação e inteligência artificial. Vitoria, ES : Incaper, 2025. p. 58. Editores: Andrea Ferreira da Costa, Jose Salazar Zanuncio Junior e Renato Correa Taques.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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6.Imagem marcado/desmarcadoSAMPAIO, B. S.; SILVA, E. O.; SALLIN, V. P.; BRANDÃO, C. T. F.; DOUSSEAU, S.; FERREIRA, T. R.; RAMOS, E. P. Algas calcárias melhoram a qualidade das mudas do mamoeiro mel. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 8. , Linhares, ES. Papaya Brasil : produção e sustentabilidade. Organizadores, David dos Santos Martins e José Aires Ventura. Vitória, ES : Incaper, 2022. Anais... Linhares, ES : Incaper, p. 605-610, 2022.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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7.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, E. P.; BARBOSA, A. K. M.; OLIVEIRA, V. de S.; HOSTE, F. G.; JEVEAUX-MACHADO, A. J. C.; ARANTES, L. de O.; SCHMILDT, E. R.; FALQUETO, A. R.; DIAS, C. da S.; DOUSSEAU, S. Producao de mudas de mamoeiro Alianca sob diferentes dosagens e fontes de obtencao de Lithothamnion sp. In: SIMPOSIO INCAPER PESQUISA, 5., Seminário de Iniciação Científica do Incaper, 5., 2025, Vitoria. Inovabilidade no campo : soluções para a resiliência dos agroecossistemas : anais. Vitoria, ES : Incaper, 2025. p. 76. Modo de acesso: World Wide Web. Editores: Rafael Nunes de Almeida, Coralline Barbosa da Silva, Danieltom Ozéias Vandermas Barbosa Vinagre e David dos Santos Martins.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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