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Biblioteca(s):  Biblioteca Rui Tendinha.
Data corrente:  24/06/2019
Data da última atualização:  24/06/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B.
Afiliação:  UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES.
Título:  Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
DOI:  10.17660/ActaHortic.2019.1239.22
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease.
Palavras-Chave:  Abacaxi.
Thesaurus NAL:  Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Biblioteca Rui Tendinha (BRT)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
BRT22610 - 1UMTAP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, H. B.; FERNANDES, P.M.B.; VENTURA, J. A. Extração, purificação parcial e comparação de duas técnicas de precipitação de enzimas proteolíticas do abacaxizeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 5p.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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2.Imagem marcado/desmarcadoPERON, F. N.; FERNANDES, P. M. B.; VENTURA, J. A. Detecção do pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV1, PMWaV2 e PMWaV3) em abacaxizeiros no Estado do Espírito Santo. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 35, p. S185, ago. 2010. Suplemento, ref. 05.091. Edição dos resumos do XLIII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Cuiabá, ago. 2010.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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3.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, S. P.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Distribuição do vírus da meleira do mamoeiro em tecidos de plantas infectadas. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 1., 2003, Vitória. MARTINS, D. dos S. (Ed.). Papaya Brasil : qualidade do mamão para o mercado interno. Vitória : Incaper, 2003. p. 601-604.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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4.Imagem marcado/desmarcadoKORRES, A. M. N.; BUSS, D. S.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Candida krusei and Kloeckera apis inhibit the causal agent of pineapple fusariosis, Fusarium guttiforme. Fungal Biology, v. 115, p. 1251-1258, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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5.Imagem marcado/desmarcadoVENTURA, J. A.; MARTINS, D. dos S.; CULIK, M. P.; COSTA, H.; FERNANDES, P. M. B. Avanços tecnológicos na cultura do mamão : controle fitossanitário. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 4., 2009, Vitória, ES. 12 p.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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6.Imagem marcado/desmarcadoPERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple. Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: - - -
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, C.; VENTURA, J. A.; COSTA, H.; FERNANDES, P. M. B.; LIMA, N. MALDI-TOF MS to identify the pineapple pathogen Fusarium guttiforme and its antagonist Trichoderma asperellum on decayed pineapple. Tropical Plant Pathology, v. 40, Issue 4, p. 227-232, august 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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8.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, S. P.; CUNHA, M. da.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Análise estrutural e histoquímica de compostos presentes no latex de plantas com meleira e sua relação com o Papaya meleira virus (PMev). In: SIMPÓSIO PAPAYA BRASILEIRO, 2., 2005, Vitória, ES. MARTINS, D dos S. (Ed.). Papaya Brasil : mercado e inovações tecnológicas para o mamão. Vitória: Incaper, 2005. p. 430-433.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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9.Imagem marcado/desmarcadoPERON, F. N. Ms.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Análisis del trasncriptoma de plantas sintomáticas y asintomáticas de piña infectadas con PMWaV. / Transcriptome analysis of symptomatic and asymptomatic PMWaV infected plants. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE FRUTICULTURA TROPICAL Y SUBTROPICAL, 5.; SIMPOSIO INTERNACIONAL DE PIÑA 'FRUTICULTURA 2017', 2017, Cuba. Por una fruticultura competitiva y sostenible : libro de resúmenes / abstract book. Cuba, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical, 2017. p. 168
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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10.Imagem marcado/desmarcadoQUADROS, O. de F.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, A. A. R.; FERNANDES, P. M. B. Atividade fungicida e larvicida de extrato proteico de folhas de mamoeiro infectadas pelo vírus da meleira. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 6., 2015, Vitória, ES. Tecnologia de produção e mercado para o mamão brasileiro : Anais... Vitória, ES : Incaper, 2015.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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11.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, S. P.; VENTURA, J. A.; ZINGALI, R. B.; FERNANDES, P. M. B. Avaliação de diferentes métodos de preparação de amostra de proteínas de folha de mamoeiro para análise proteômica por eletroforese bi-dimensional. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 5p.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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12.Imagem marcado/desmarcadoDETONI, J. L.; KORRES, A. M. N.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Estudo de enzimas proteolíticas e pectinolíticas relacionadas a microrganismos associados à podridão espumosa do abacaxi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 5p.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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13.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, S. P.; VENTURA, J. A.; ZINGALE, R. B.; FERNANDES, P. M. B. Evaluation of sample preparation methods for the analysis of papaya leaf proteins through two-dimensional gel electrophoresis. Phytochemical Analysis, v. 20, n. 6, p. 456-464, 2009.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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14.Imagem marcado/desmarcadoQUADROS, O. de F.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, A. A. R.; FERNANDES, P. M. R. Edição dirigida do genoma por CRISPR/Cas9: uma nova tecnologia para o melhoramento de plantas. INCAPER EM REVISTA, Vitória, v. 9, p. 06-15, jan. a dez. 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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15.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, S. P.; CUNHA, M. da.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Effcts of the Papaya meleira virus on papaya latex structure and composition. BIOTIC AND BIOTIC STRESS, v. 28, n. 5, p. 861-871, 2009.
Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha.
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16.Imagem marcado/desmarcadoCARNIELLI, L.; FERNANDES, P. M. B.; FERNANDES, A. A. R.; VENTURA, J. A. Diagnóstico molecular de Fusarium guttiforme com PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 48.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PATOLOGIA PÓS-COLHEITA, 2., 2015, São Pedro, SP. Fitopatologia de precisão: fronteiras da ciência: anais. São Pedro, SP: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2015.
Tipo: Publicação em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, S. P.; GALVÃO, O. P.; ANDRADE, J. S.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Modo molecular simplificado para o diagnóstico da meleira do mamoeiro em látex e tecidos de plantas infectadas. Summa Phytopathologica, v. 31, n. 3, p. 273-275, jul./set. 2005
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: - - -
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18.Imagem marcado/desmarcadoCARNIELLI, L.; AMORIM, W. A.; VAZ, A.; FERNANDES, P. M. B.; VENTURA, J. A. Molecular diagnosis of Fusarium guttiforme and Pineapple mealybug wilt-associated virus. BMC Proceedings 2014 8(Suppl 4):P121. This article is part of the supplement: The 5th Congress of the Brazilian Biotechnology Society (SBBIOTEC): Meeting abstracts.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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19.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, S. P.; ANDRADE, J. de S.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. New approach for papaya latex storage without virus degradation. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v. 40, n. 1, mar. 2009.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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20.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, H. B.; FERNANDES, P. M. B.; ROMÃO, W.; VENTURA, J. A. A new procedure based on column chromatography to purify bromelain by ion exchange plus gel filtration chromatographies. Industrial Crops and Products, Vol. 59, p. 163-168, august 2014. 6 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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