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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Biblioteca Rui Tendinha. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@incaper.es.gov.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
24/06/2019 |
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Data da última atualização: |
24/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. |
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Afiliação: |
UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES. |
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Título: |
Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019. |
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DOI: |
10.17660/ActaHortic.2019.1239.22 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease. |
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Palavras-Chave: |
Abacaxi. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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773 $tActa Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
29/11/2017 |
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Data da última atualização: |
10/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Publicação em Anais de Congresso |
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Autoria: |
GUARÇONI, R. G.; SILVA, S. S. da.; GALVÃO, R. N.; BAPTISTI, L. C.; ROCHA, M. G. da.; BERGAMIN, A. K. S.; RONCETE, M. E. de S.; BATISTA, L. M.; CARDOSO, W. S.; GOMES, S. A.; SANTOS, L. C. |
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Afiliação: |
Rogerio Carvalho Guarçoni, Incaper; Silvana Soares da Silva, IFES Venda Nova do Imigrante; Rafael Nobre Galvão, IFES Venda Nova Imigrante; Letícia Caliman Baptisti, IFES Venda Nova do Imigrante; Mariana Grigório da Rocha, IFES Venda Nova do Imigrante; Ana Karoline Soave Bergamin, IFES Venda Nova do Imigrante; Maria Eduarda de Souza Roncete, IFES Venda Noa do Imigrante; Larissa Moreira Batista, IFES Venda Nova do Imigrante; Wilton Soares Cardoso, IFES Venda Nova do Imigrante; Sebastião Antônio Gomes, Incaper; Lucas Calazans Santos, Incaper. |
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Título: |
Quantidade de frutos para determinar o tamanho de amostra de características de tangerina pelo método de Bootstrap. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 21.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS GRADUAÇÃO, 17.; ENCONTRO NACIONAL DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 7., 2017, São José dos Campos. Ciência Que Aproxima, Ciência Que Liberta. São José dos Campos: UNIVAP, 2017. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Em ensaios agrícolas, os pesquisadores devem definir o número mínimo de dados visando aumentar a precisão através das informações obtidas, além de melhorar a relação custo/benefício dos experimentos, gerando novas tecnologias com menores custos. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi determinar a quantidade mínima de frutos necessária para dimensionar o tamanho de amostra e determinar os tamanhos de amostras em função dos erros de estimação em percentagem de 1 a 10%, para avaliar características de Tangerina Ponkan. O trabalho foi conduzido no IFES de Venda Nova do Imigrante, onde foram mensuradas, após a colheita, as características massa de suco, massa, diâmetro e altura de frutos de 120 frutos de tangerina Ponkan. Para determinar os tamanhos de amostras em função dos erros de estimação em percentagem, para as características estudadas, são necessários pelo menos 105 frutos. Os tamanhos de amostras para avaliar as características massa de suco, altura de fruto, massa de fruto e diâmetro de fruto variaram, respectivamente, de 1331, 474, 461 e 158 frutos para o erro de estimação em percentagem de 1% até 14, 5, 2 e 5 frutos para o erro de 10%. |
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Palavras-Chave: |
Citros; Dimensionamento amostral; Erro de estimação; INC; Simulação; Tangerina Ponkan. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://biblioteca.incaper.es.gov.br/digital/bitstream/123456789/2868/1/BRT-quantidadedefrutosparadeterminarotamanhodeamostradecaracteristicasdetangerinas-guarconi-iniciacao.pdf
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Marc: |
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245 $aQuantidade de frutos para determinar o tamanho de amostra de características de tangerina pelo método de Bootstrap.$h[electronic resource]
260 $aIn: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 21.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS GRADUAÇÃO, 17.; ENCONTRO NACIONAL DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 7., 2017, São José dos Campos. Ciência Que Aproxima, Ciência Que Liberta. São José dos Campos: UNIVAP$c2017
520 $aEm ensaios agrícolas, os pesquisadores devem definir o número mínimo de dados visando aumentar a precisão através das informações obtidas, além de melhorar a relação custo/benefício dos experimentos, gerando novas tecnologias com menores custos. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi determinar a quantidade mínima de frutos necessária para dimensionar o tamanho de amostra e determinar os tamanhos de amostras em função dos erros de estimação em percentagem de 1 a 10%, para avaliar características de Tangerina Ponkan. O trabalho foi conduzido no IFES de Venda Nova do Imigrante, onde foram mensuradas, após a colheita, as características massa de suco, massa, diâmetro e altura de frutos de 120 frutos de tangerina Ponkan. Para determinar os tamanhos de amostras em função dos erros de estimação em percentagem, para as características estudadas, são necessários pelo menos 105 frutos. Os tamanhos de amostras para avaliar as características massa de suco, altura de fruto, massa de fruto e diâmetro de fruto variaram, respectivamente, de 1331, 474, 461 e 158 frutos para o erro de estimação em percentagem de 1% até 14, 5, 2 e 5 frutos para o erro de 10%.
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653 $aINC
653 $aSimulação
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700 1 $aBATISTA, L. M.
700 1 $aCARDOSO, W. S.
700 1 $aGOMES, S. A.
700 1 $aSANTOS, L. C.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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