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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
24/06/2019 |
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Data da última atualização: |
24/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. |
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Afiliação: |
UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES. |
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Título: |
Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019. |
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DOI: |
10.17660/ActaHortic.2019.1239.22 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease. |
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Palavras-Chave: |
Abacaxi. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 01796naa a2200265 a 4500
001 1021431
005 2019-06-24
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.17660/ActaHortic.2019.1239.22$2DOI
100 1 $aPERON, F. N.
245 $aBioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple.$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aMealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease.
650 $aBioinformatics
650 $aDESeq2
650 $aEdgeR
650 $aPineapple
650 $aPMWaV
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650 $aTranscriptomic
653 $aAbacaxi
700 1 $aCALLONI, R.
700 1 $aVENTURA, J. A.
700 1 $aFERNANDES, P. M. B.
773 $tActa Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
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Registro |
Volume |
Status |
Fechar
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| Registros recuperados : 177 | |
| 61. |  | CALATRONI, D.; DOUSSEAU, S.; SILVA, J. F.; LAVANHOLE, D. F.; CERRI NETO, B.; LEITE, L. A.; SCHMILDT, E. R.; ARANTES, L. de O. Determinação do ponto de colheita do abacaxizeiro da cultivar 'Vitória'. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E TECNOLÓGICA (SICT) DO INCAPER, 2., 2017. JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, DESENVOLVIMENTO TECNOLÓGICO E INOVAÇÃO DO IFES, 12., 2017. Colatina, ES : IFES; Incaper, 2017. Resumo.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 62. | | CARNIELLI, L.; FERNANDES, P. M. B.; FERNANDES, A. A. R.; VENTURA, J. A. Diagnóstico molecular de Fusarium guttiforme com PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 48.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PATOLOGIA PÓS-COLHEITA, 2., 2015, São Pedro, SP. Fitopatologia de precisão: fronteiras da ciência: anais. São Pedro, SP: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2015.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 64. | | CAETANO, L. C. S.; VENTURA, J. A.; COSTA, A. de F. S. da.; GUARÇONI, R. G. Efeito da adubação com nitrogênio, fósforo e potássio no desenvolvimento, na produção e na qualidade de frutos de abacaxi 'Vitória'. Rev. Bras. Frutic., Jaboticabal, SP, v. 35, n. 3, p. 883-890, Setembro 2013. 8p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 65. | | BREGONCI, I. dos S.; BRUM, V. J.; ALMEIDA, G. D. de.; ZUCOLOTO, M.; COELHO, R. I. Efeito da adubação foliar e recipiente no crescimento da parte aérea de mudas micropropagadas do abacaxizeiro cv. Gold. In: ENCONTRO LATINO AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 11.; ENCONTRO LATINO AMERICANO PÓS-GRADUAÇÃO, 7., 2006, São José dos Campos, SP.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 66. | | ALONSO, S. K.; BARRETO, M.; COSTA, A. F.; SILVA-ACUÑA, R.; ZAMBOLIM, L.; VENTURA, J. A. Efeito da urina de vaca no crescimento "in vitro" de fusarium subglutinans. FITOPATOLOGIA BRASILEIRA, v. 19, n. 2, p. 235-237, 1994.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: - - - |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 67. | | BREGONCI, I. dos S.; BRUM, V. J.; ALMEIDA, G. D. de.; ZUCOLOTO, M. Z.; COELHO, R. C. Efeito de recipientes e adubação foliar no desenvolvimento radicular de mudas micropropagadas do abacaxizeiro cv. Gold. In: ENCONTRO LATINO AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 11.; ENCONTRO LATINO AMERICANO PÓS-GRADUAÇÃO, 7., 2006, São José dos Campos, SP.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 68. | | LIMA, K. C. C.; DOUSSEAU, S.; COSTA, R. J.; ARANTES, L. de O.; CERRI-NETO, B.; MULINARI, M. Z. C. R.; BRANDES, M. F. Efeito do paclobutrazol no controle da floração natural do abacaxizeiro cv. Vitória e cv. Pérola. In: JORNADA DE INTEGRAÇÃO DO IFES, 3., 2019. JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, DESENVOLVIMENTO TECNOLÓGICO E INOVAÇÃO DO IFES, 14., 2019. SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E TECNOLÓGICA (SICT) DO INCAPER, 3., 2018 e 2019. Alegre, ES : IFES; Incaper, 2019. Resumo.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 72. | | SANTOS, J. G. dos.; ZUCOLOTO, M.; SILVA, D. P. da.; BREGONCI, I. dos S.; LOPES, J. C.; COELHO, R. I. Emprego da coroa do abacaxizeiro {Ananás comosus (L.) Merr.} na produção de mudas do tipo rebentão. In: ENCONTRO LATINO AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10.; ENCONTRO LATINO AMERICANO PÓS-GRADUAÇÃO, 7., 2006, São José dos Campos, SP.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 77. | | ZAMPERLINI, G. P.; CUNHA, J. T.; VENTURA, J. A.; SILVA, D. M. Estudo da eficiência fotossintética em três cultivares de abacaxizeiro (Ananas comocus L. Merril). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 5p.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 78. | | DETONI, J. L.; KORRES, A. M. N.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. Estudo de enzimas proteolíticas e pectinolíticas relacionadas a microrganismos associados à podridão espumosa do abacaxi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. 5p.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 79. | | VENTURA, J. A.; ZAMBOLIM, L. Etiologia e disseminação da doença. In: RUGGIERO, C.; VENTURA, J. A.; MARTINEZ JÚNIOR, M.; ZAMBOLIM, L.; CHAVES, G. M.; NOGUEIRA FILHO, G. C.; GOTTARDI, M. V. C. Controle integrado de fusariose do do abacaxizeiro. Jaboticabal: FUNEP, 1994.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 80. | | CULIK, M. P.; VENTURA, J. A.; MARTINS, D. dos S. Evaluación de un cebo para el manejo integrado de plaga de hormigas en frutales tropicales en Espiritú Santo, Brasil. / Evaluation of a bait for integrated pest management (IPM) of ants in tropical fruit crops in Espírito Santo, Brazil. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE FRUTICULTURA TROPICAL Y SUBTROPICAL, 5.; SIMPOSIO INTERNACIONAL DE PIÑA 'FRUTICULTURA 2017', 2017, Cuba. Por una fruticultura competitiva y sostenible : libro de resúmenes / abstract book. Cuba, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical, 2017. p. 167 Resumo.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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